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Large-scale phenotyping of patients with long COVID post-hospitalization reveals mechanistic subtypes of disease
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. 25(4):607-621
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Unsupervised machine learning to investigate trajectory patterns of COVID-19 symptoms and physical activity measured via the MyHeart Counts App and smart devices
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Omicron infection following vaccination enhances a broad spectrum of immune responses dependent on infection history
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Effect of second booster vaccinations and prior infection against SARS-CoV-2 in the UK SIREN healthcare worker cohort
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Hall, Victoria J.
Foulkes, Sarah
Otter, Ashley D.
Munro, Katie
Sparkes, Dominic
Howells, Anna
Platt, Naomi
Broad, Jonathan
Crossman, David
Norman, Chris
Corrigan, Diane
Jackson, Christopher H.
Cole, Michelle
Brown, Colin S.
Atti, Ana
Islam, Jasmin
Presanis, Anne M.
Charlett, Andre
De
Angelis, Daniela
Hopkins, Susan
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5
SARS-CoV-2-specific immune responses and clinical outcomes after COVID-19 vaccination in patients with immune-suppressive disease
학술저널
issue
Nature Medicine
. 29(7):1760-1774
Author
Barnes, Eleanor
Aff1, Aff2
Goodyear, Carl S.
Willicombe, Michelle
Gaskell, Charlotte
Siebert, Stefan
I
de
Silva
,
Thushan
Murray, Sam M.
Rea, Daniel
Snowden, John A.
Carroll, Miles
Pirrie, Sarah
Bowden, Sarah J.
Dunachie, Susanna J.
Aff1, Aff2
Richter, Alex
Lim, Zixiang
Satsangi, Jack
Cook, Gordon
Pope, Ann
Hughes, Ana
Harrison, Molly
Lim, Sean H.
Miller, Paul
Klenerman, Paul
Aff1, Aff2
Basu, Neil
Gilmour, Ashley
Irwin, Sophie
Meacham, Georgina
Marjot, Thomas
Dimitriadis, Stavros
Kelleher, Peter
Prendecki, Maria
Clarke, Candice
Mortimer, Paige
McIntyre, Stacey
Selby, Rachael
Meardon, Naomi
Nguyen, Dung
Tipton, Tom
Longet, Stephanie
Laidlaw, Stephen
Orchard, Kim
Ireland, Georgina
Thomas, David
Kearns, Pamela
Aff5, Aff16
Kirkham, Amanda
McInnes, Iain B.
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6
Genomic reconstruction of the SARS-CoV-2 epidemic in England
학술저널
issue
Nature
. 600(7889)
Author
Robson, Samuel C
Connor, Thomas R
Loman, Nicholas J
Golubchik, Tanya
Martinez Nunez, Rocio T
Bonsall, David
Rambaut, Andrew
Snell, Luke B
Ludden, Catherine
Corden, Sally
Nastouli, Eleni
Nebbia, Gaia
Lythgoe, Katrina
Torok, M Estee
Goodfellow, Ian G
Prieto, Jacqui A
Saeed, Kordo
Houlihan, Catherine
Frampton, Dan
Hamilton, William L
Witney, Adam A
Bucca, Giselda
Pope, Cassie F
Moore, Catherine
Thomson, Emma C
Harrison, Ewan M
Smith, Colin P
Rogan, Fiona
Beckwith, Shaun M
Murray, Abigail
Singleton, Dawn
Eastick, Kirstine
Sheridan, Liz A
Randell, Paul
Jackson, Leigh M
Gonçalves, Sónia
Fairley, Derek J
Loose, Matthew W
Watkins, Joanne
Moses, Samuel
Nicholls, Sam
Bull, Matthew
Smith, Darren L
Aanensen, David M
Aggarwal, Dinesh
Shepherd, James G
Curran, Martin D
Parmar, Surendra
Parker, Matthew D
Williams, Catryn
Glaysher, Sharon
Underwood, Anthony P
Bashton, Matthew
Pacchiarini, Nicole
Loveson, Katie F
Byott, Matthew
Carabelli, Alessandro M
Templeton, Kate E
de
Silva
,
Thushan
I
Wang, Dennis
Langford, Cordelia F
Gunson, Rory N
Cottrell, Simon
O’Grady, Justin
Kwiatkowski, Dominic
Lillie, Patrick J
Cortes, Nicholas
Moore, Nathan
Thomas, Claire
Burns, Phillipa J
Mahungu, Tabitha W
Liggett, Steven
Beckett, Angela H
Holden, Matthew TG
Levett, Lisa J
Osman, Husam
Hassan-Ibrahim, Mohammed O
Simpson, David A
Chand, Meera
Gupta, Ravi K
Darby, Alistair C
Paterson, Steve
Pybus, Oliver G
Volz, Erik
de
Angelis, Daniela
Robertson, David L
Page, Andrew J
Bassett, Andrew R
Wong, Nick
Taha, Yusri
Erkiert, Michelle J
Spencer Chapman, Michael H
Dewar, Rebecca
McHugh, Martin P
Mookerjee, Siddharth
Aplin, Stephen
Harvey, Matthew
Sass, Thea
Umpleby, Helen
Wheeler, Helen
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Open Access (eScholarship)
7
Development and characterization of a hemolysis inhibition assay to determine functionality of anti-Streptolysin O antibodies in human sera
학술저널
issue
In
Journal of Immunological Methods
March 2024 526
Author
Carducci, Martina
Whitcombe, Alana
Rovetini, Luca
Massai, Luisa
Keeley, Alexander J.
de
Silva
,
Thushan
I.
Bennett, Julie
Berlanda Scorza, Francesco
Iturriza, Miren
Moreland, Nicole J.
Moriel, Danilo G.
Rossi, Omar
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8
The impact of viral mutations on recognition by SARS-CoV-2 specific T cells
학술저널
issue
iScience
. 24(11)
Author
de
Silva
,
Thushan
I
Liu, Guihai
Lindsey, Benjamin B
Dong, Danning
Moore, Shona C
Hsu, Nienyun Sharon
Shah, Dhruv
Wellington, Dannielle
Mentzer, Alexander J
Angyal, Adrienn
Brown, Rebecca
Parker, Matthew D
Ying, Zixi
Yao, Xuan
Turtle, Lance
Dunachie, Susanna
Aanensen, David M
Abudahab, Khalil
Adams, Helen
Adams, Alexander
Afifi, Safiah
Aggarwal, Dinesh
Ahmad, Shazaad SY
Aigrain, Louise
Alcolea-Medina, Adela
Alikhan, Nabil-Fareed
Allara, Elias
Amato, Roberto
Annett, Tara
Aplin, Stephen
Ariani, Cristina V
Asad, Hibo
Ash, Amy
Ashfield, Paula
Ashford, Fiona
Atkinson, Laura
Attwood, Stephen W
Auckland, Cressida
Aydin, Alp
Baker, David J
Baker, Paul
Balcazar, Carlos E
Ball, Jonathan
Barrett, Jeffrey C
Barrow, Magdalena
Barton, Edward
Bashton, Matthew
Bassett, Andrew R
Batra, Rahul
Baxter, Chris
Bayzid, Nadua
Beaver, Charlotte
Beckett, Angela H
Beckwith, Shaun M
Bedford, Luke
Beer, Robert
Beggs, Andrew
Bellis, Katherine L
Berry, Louise
Bertolusso, Beatrice
Best, Angus
Betteridge, Emma
Bibby, David
Bicknell, Kelly
Binns, Debbie
Birchley, Alec
Bird, Paul W
Bishop, Chloe
Blacow, Rachel
Blakey, Victoria
Blane, Beth
Bolt, Frances
Bonfield, James
Bonner, Stephen
Bonsall, David
Boswell, Tim
Bosworth, Andrew
Bourgeois, Yann
Boyd, Olivia
Bradley, Declan T
Breen, Cassie
Bresner, Catherine
Breuer, Judith
Bridgett, Stephen
Bronner, Iraad F
Brooks, Ellena
Broos, Alice
Brown, Julianne R
Bucca, Giselda
Buchan, Sarah L
Buck, David
Bull, Matthew
Burns, Phillipa J
Burton-Fanning, Shirelle
Byaruhanga, Timothy
Byott, Matthew
Campbell, Sharon
Carabelli, Alessandro M
Cargill, James S
Carlile, Matthew
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Open Access (eScholarship)
9
SARS-CoV-2 variant biology: immune escape, transmission and fitness
학술저널
issue
Nature Reviews Microbiology
. 21(3):162-177
Author
Carabelli, Alessandro M.
Peacock, Thomas P.
Thorne, Lucy G.
Harvey, William T.
Aff4, Aff5
Hughes, Joseph
Peacock, Sharon J.
Barclay, Wendy S.
de
Silva
,
Thushan
I.
Towers, Greg J.
Robertson, David L.
Aff4, IDs41579022008417_cor11
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10
Recurrent emergence of SARS-CoV-2 spike deletion H69/V70 and its role in the Alpha variant B.1.1.7
학술저널
issue
Cell Reports
. 35(13)
Author
Meng, Bo
Kemp, Steven A
Papa, Guido
Datir, Rawlings
Ferreira, Isabella ATM
Marelli, Sara
Harvey, William T
Lytras, Spyros
Mohamed, Ahmed
Gallo, Giulia
Thakur, Nazia
Collier, Dami A
Mlcochova, Petra
Consortium, The COVID-19 Genomics UK
Robson, Samuel C
Loman, Nicholas J
Connor, Thomas R
Golubchik, Tanya
Nunez, Rocio T Martinez
Ludden, Catherine
Corden, Sally
Johnston, Ian
Bonsall, David
Smith, Colin P
Awan, Ali R
Bucca, Giselda
Torok, M Estee
Saeed, Kordo
Prieto, Jacqui A
Jackson, David K
Hamilton, William L
Snell, Luke B
Moore, Catherine
Harrison, Ewan M
Goncalves, Sonia
Fairley, Derek J
Loose, Matthew W
Watkins, Joanne
Livett, Rich
Moses, Samuel
Amato, Roberto
Nicholls, Sam
Bull, Matthew
Smith, Darren L
Barrett, Jeff
Aanensen, David M
Curran, Martin D
Parmar, Surendra
Aggarwal, Dinesh
Shepherd, James G
Parker, Matthew D
Glaysher, Sharon
Bashton, Matthew
Underwood, Anthony P
Pacchiarini, Nicole
Loveson, Katie F
Templeton, Kate E
Langford, Cordelia F
Sillitoe, John
de
Silva
,
Thushan
I
Wang, Dennis
Kwiatkowski, Dominic
Rambaut, Andrew
O’Grady, Justin
Cottrell, Simon
Holden, Matthew TG
Thomson, Emma C
Osman, Husam
Andersson, Monique
Chauhan, Anoop J
Hassan-Ibrahim, Mohammed O
Lawniczak, Mara
Alderton, Alex
Chand, Meera
Constantinidou, Chrystala
Unnikrishnan, Meera
Darby, Alistair C
Hiscox, Julian A
Paterson, Steve
Martincorena, Inigo
Volz, Erik M
Page, Andrew J
Pybus, Oliver G
Bassett, Andrew R
Ariani, Cristina V
Chapman, Michael H Spencer
Li, Kathy K
Shah, Rajiv N
Jesudason, Natasha G
Taha, Yusri
McHugh, Martin P
Dewar, Rebecca
Jahun, Aminu S
McMurray, Claire
Pandey, Sarojini
McKenna, James P
Nelson, Andrew
Young, Gregory R
McCann, Clare M
Elliott, Scott
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