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[키워드: "Xirasagar, Sandhya"]
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research in computational molecular biology : 26th annual international conference, recomb 2022, san diego, ca, usa, may 22-25, 2022, proceedings
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oxford university press
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oxford university press / usa
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PhenoTagger: A Hybrid Method for Phenotype Concept Recognition using Human Phenotype Ontology
보고서
Author
Luo, Ling
Yan, Shankai
Lai, Po-Ting
Veltri, Daniel
Oler, Andrew
Xirasagar
,
Sandhya
Ghosh, Rajarshi
Similuk, Morgan
Robinson, Peter N.
Lu, Zhiyong
DB Label
Database : arXiv
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Open Access (Arxiv)
2
ImmunoTyper-SR: A Novel Computational Approach for Genotyping Immunoglobulin Heavy Chain Variable Genes Using Short Read Data
전자책
issue
Research in Computational Molecular Biology : 26th Annual International Conference, RECOMB 2022, San Diego, CA, USA, May 22–25, 2022, Proceedings
. 13278:382-384
Author
SPS NIAID COVID Consortium
Ford, Michael
Aff9
Hari, Ananth
Aff9, Aff11
Rodriguez, Oscar
Aff12
Xu, Junyan
Aff9
Lack, Justin
Aff10
Oguz, Cihan
Aff10
Zhang, Yu
Aff10
Weber, Sarah
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Magliocco, Mary
Aff10
Barnett, Jason
Aff10
Xirasagar
,
Sandhya
Aff10
Samuel, Smilee
Aff10
Imberti, Luisa
Aff14
Bonfanti, Paolo
Aff15
Biondi, Andrea
Aff15
Dalgard, Clifton L.
Aff13
Chanock, Stephen
Aff9
Rosen, Lindsey
Aff10
Holland, Steven
Aff10
Su, Helen
Aff10
Notarangelo, Luigi
Aff10
Vishkin, Uzi
Aff11
Watson, Corey
Aff12
Sahinalp, S. Cenk
Aff9
DB Label
Database : Springer Nature eBooks
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3
Perturbations of the T-cell receptor repertoire in response to SARS-CoV-2 in immunocompetent and immunocompromised individuals
학술저널
issue
In
The Journal of Allergy and Clinical Immunology
December 2023
Author
Delmonte, Ottavia M.
Oguz, Cihan
Dobbs, Kerry
Myint-Hpu, Katherine
Palterer, Boaz
Abers, Michael S.
Draper, Deborah
Truong, Meng
Kaplan, Ian M.
Gittelman, Rachel M.
Zhang, Yu
Rosen, Lindsey B.
Snow, Andrew L.
Dalgard, Clifton L.
Burbelo, Peter D.
Imberti, Luisa
Sottini, Alessandra
Quiros-Roldan, Eugenia
Castelli, Francesco
Rossi, Camillo
Brugnoni, Duilio
Biondi, Andrea
Bettini, Laura Rachele
D’Angio, Mariella
Bonfanti, Paolo
Anderson, Megan V.
Saracino, Annalisa
Chironna, Maria
Di Stefano, Mariantonietta
Fiore, Jose Ramon
Santantonio, Teresa
Castagnoli, Riccardo
Marseglia, Gian Luigi
Magliocco, Mary
Bosticardo, Marita
Pala, Francesca
Shaw, Elana
Matthews, Helen
Weber, Sarah E.
Xirasagar
,
Sandhya
Barnett, Jason
Oler, Andrew J.
Dimitrova, Dimana
Bergerson, Jenna R.E.
McDermott, David H.
Rao, V. Koneti
Murphy, Philip M.
Holland, Steven M.
Lisco, Andrea
Su, Helen C.
Lionakis, Michail S.
Cohen, Jeffrey I.
Freeman, Alexandra F.
Snyder, Thomas M.
Lack, Justin
Notarangelo, Luigi D.
DB Label
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4
PhenoRerank: A re-ranking model for phenotypic concept recognition pre-trained on human phenotype ontology
학술저널
issue
In
Journal of Biomedical Informatics
May 2022 129
Author
Yan, Shankai
Luo, Ling
Lai, Po-Ting
Veltri, Daniel
Oler, Andrew J.
Xirasagar
,
Sandhya
Ghosh, Rajarshi
Similuk, Morgan
Robinson, Peter N.
Lu, Zhiyong
DB Label
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5
Balancing Confidentiality and Sharing of Genomic and Phenotypic Data in a Clinical Research System
회의자료
issue
Proceedings of the 2018 ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics
. :533-533
Author
Veltri, Daniel
Li, Zhiwen
Xirasagar
,
Sandhya
Oler, Andrew J.
Cheng, Xi
Huang, Ke
Barnett, Jason
Zhang, Lingwen
Juarez-Espinosa, Octavio
Fan, Yongjie
Similuk, Morgan
Walkiewicz, Magdalena
Hong, Celine
Johnson, Joyce
Milner, Joshua D.
DB Label
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6
ImmunoTyper-SR: A computational approach for genotyping immunoglobulin heavy chain variable genes using short-read data
학술저널
issue
CELL SYSTEMS
; OCT 19 2022, 13 10, p808-p+, 15p.
Author
Ford, Michael K. B.
Hari, Ananth
Rodriguez, Oscar
Xu, Junyan
Lack, Justin
Oguz, Cihan
Zhang, Yu
Weber, Sarah
Magliocco, Mary
Barnett, Jason
Xirasagar
,
Sandhya
Samuel, Smilee
Imberti, Luisa
Bonfanti, Paolo
Biondi, Andrea
Dalgard, Clifton L.
Chanock, Stephen
Rosen, Lindsey
Holland, Steven
Su, Helen
Notarangelo, Luigi
Vishkin, Uzi
Watson, Corey T.
Sahinalp, S. Cenk
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7
Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations
학술저널
issue
JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY
; OCT 2022, 150 4, p947-p954, 8p.
Author
Similuk, Morgan N.
Yan, Jia
Ghosh, Rajarshi
Oler, Andrew J.
Franco, Luis M.
Setzer, Michael R.
Kamen, Michael
Jodarski, Colleen
DiMaggio, Thomas
Davis, Joie
Gore, Rachel
Jamal, Leila
Borges, Adrienne
Gentile, Nicole
Niemela, Julie
Lowe, Chenery
Jevtich, Kathleen
Yu, Yunting
Hullfish, Haley
Hsu, Amy P.
Hong, Celine
Littel, Patricia
Seifert, Bryce A.
Milner, Joshua
Johnston, Jennifer J.
Cheng, Xi
Li, Zhiwen
Veltri, Daniel
Huang, Ke
Kaladi, Krishnaveni
Barnett, Jason
Zhang, Lingwen
Vlasenko, Nikita
Fan, Yongjie
Karlins, Eric
Ganakammal, Satishkumar Ranganathan
Gilmore, Robert
Tran, Emily
Yun, Alvin
Mackey, Joseph
Yazhuk, Svetlana
Lack, Justin
Kuram, Vasudev
Cao, Wenjia
Huse, Susan
Frank, Karen
Fahle, Gary
Rosenzweig, Sergio
Su, Yan
Hwang, SuJin
Bi, Weimin
Bennett, John
Myles, Ian A.
De Ravin, Suk See
Fuss, Ivan
Strober, Warren
Bielekova, Bibiana
de Jesus, Adriana Almeida
Goldbach-Mansky, Raphaela
Williamson, Peter
Kumar, Kelly
Dempsy, Caeden
Frischmeyer-Guerrerio, Pamela
Fisch, Robin
Bolan, Hyejeong
Metcalfe, Dean D.
Komarow, Hirsh
Carter, Melody
Druey, Kirk M.
Sereti, Irini
Dropulic, Lesia
Klion, Amy D.
Khoury, Paneez
O' Connell, Elise M.
Holland-Thomas, Nicole C.
Brown, Thomas
McDermott, David H.
Murphy, Philip M.
Bundy, Vanessa
Keller, Michael D.
Peng, Christine
Kim, Helen
Norman, Stephanie
Delmonte, Ottavia M.
Kang, Elizabeth
Su, Helen C.
Malech, Harry
Freeman, Alexandra
Zerbe, Christa
Uzel, Gulbu
Bergerson, Jenna R. E.
Rao, V. Koneti
Olivier, Kenneth N.
Lyons, Jonathan J.
Lisco, Andrea
Cohen, Jeffrey, I
Lionakis, Michail S.
Biesecker, Leslie G.
Xirasagar
,
Sandhya
Notarangelo, Luigi D.
Holland, Steven M.
Walkiewicz, Magdalena A.
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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Full Text (ScienceDirect)
Full Text (Clinical Key)
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조회 - Impact Factor (JCR)
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8
PhenoTagger: a hybrid method for phenotype concept recognition using human phenotype ontology
학술저널
issue
BIOINFORMATICS
; JUL 1 2021, 37 13, p1884-p1890, 7p.
Author
Luo, Ling
Yan, Shankai
Lai, Po-Ting
Veltri, Daniel
Oler, Andrew
Xirasagar
,
Sandhya
Ghosh, Rajarshi
Similuk, Morgan
Robinson, Peter N.
Lu, Zhiyong
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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조회 - Impact Factor (JCR)
9
The Papillomavirus Episteme: a central resource for papillomavirus sequence data and analysis
학술저널
issue
Nucleic Acids Research
. Jan 01, 2013 41(D1):D571-D578
Author
Van Doorslaer, Koenraad
Tan, Qina
Xirasagar
,
Sandhya
Bandaru, Sandya
Gopalan, Vivek
Mohamoud, Yasmin
Huyen, Yentram
McBride, Alison A.
DB Label
Database : Journals@OVID
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조회 - Impact Factor (JCR)
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CEBS—Chemical Effects in Biological Systems: a public data repository integrating study design and toxicity data with microarray and proteomics data
학술저널
issue
Nucleic Acids Research
. Jan 01, 2008 36 Database issue:D892-D900
Author
Waters, Michael
Stasiewicz, Stanley
Alex Merrick, B.
Tomer, Kenneth
Bushel, Pierre
Paules, Richard
Stegman, Nancy
Nehls, Gerald
Yost, Kenneth J.
Johnson, C. Harris
Gustafson, Scott F.
Xirasagar
,
Sandhya
Xiao, Nianqing
Huang, Cheng-Cheng
Boyer, Paul
Chan, Denny D.
Pan, Qinyan
Gong, Hui
Taylor, John
Choi, Danielle
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Ahmed, Ayazaddin
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Selkirk, James
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