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Karan, Dev
Wick, Jo
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Siddiqui, Javed
Kunju, Lakshmi P
Iczkowski, Kenneth A
Chinnaiyan, Arul M
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Clinical Efficacy of ONC201 in H3K27M-Mutant Diffuse Midline Gliomas Is Driven by Disruption of Integrated Metabolic and Epigenetic Pathways.
학술저널
issue
Cancer Discovery
. 13(11)
Author
Sweha, Stefan
Mota, Mateus
Pun, Matthew
Deogharkar, Akash
Chung, Chan
Tarapore, Rohinton
Ramage, Samuel
Chi, Andrew
Wen, Patrick
Arrillaga-Romany, Isabel
Batchelor, Tracy
Butowski, Nicholas
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Mottl, Sophie
Cartaxo, Rodrigo
John, Vishal
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Qin, Tingting
Peterson, Erik
Sajjakulnukit, Peter
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Walling, Dustin
Ding, Yujie
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Schwendeman, Anna
Hawes, Debra
Yang, Fusheng
Judkins, Alexander
Wahl, Daniel
Lyssiotis, Costas
de la Nava, Daniel
Alonso, Marta
Eze, Augustine
Spitzer, Jasper
Schmidt, Susanne
Duchatel, Ryan
Dun, Matthew
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Baquer, Gerard
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Filbin, Mariella
Agar, Nathalie
Zhao, Lili
Kumar
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Pratt, Drew
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Grill, Jacques
Kline, Cassie
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Kawakibi, Abed
Ji, Sunjong
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Nazarian, Javad
Allen, Joshua
Odia, Yazmin
Gardner, Sharon
Koschmann, Carl
Mueller, Sabine
Waszak, Sebastian
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
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Clinical, genomic, and epigenomic analyses of H3K27M-mutant diffuse midline glioma long-term survivors reveal a distinct group of tumors with MAPK pathway alterations
학술저널
issue
Acta Neuropathologica: Pathology and Mechanisms of Neurological Disease
. 146(6):849-852
Author
Roberts, Holly J.
Ji, Sunjong
Picca, Alberto
Sanson, Marc
Aff2, Aff3, Aff4
Garcia, Mekka
Snuderl, Matija
Schüller, Ulrich
Aff7, Aff8, Aff9
Picart, Thiébaud
Ducray, François
Green, Adam L.
Nakano, Yoshiko
Aff13, Aff14
Sturm, Dominik
Aff15, Aff16, Aff17
Abdullaev, Zied
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Chandan
Aff19, Aff20
Wu, Yi-Mi
Aff19, Aff20
Robinson, Dan
Aff19, Aff20
Vo, Josh N.
Aff19, Aff20
Chinnaiyan, Arul M.
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Cartaxo, Rodrigo
Upadhyaya, Santhosh A.
Mody, Rajen
Chiang, Jason
Baker, Suzanne
Solomon, David
Venneti, Sriram
Aff1, Aff19
Pratt, Drew
Waszak, Sebastian M.
Aff28, Aff29, Aff30, IDs00401023026407_cor29
Koschmann, Carl
Aff1, Aff31, IDs00401023026407_cor30
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Somatic SLC30A1 mutations altering zinc transporter ZnT1 cause aldosterone-producing adenomas and primary aldosteronism
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Nature Genetics
. 55(10):1623-1631
Author
Rege, Juilee
Bandulik, Sascha
Nanba, Kazutaka
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Blinder, Amy R.
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Reincke, Martin
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Udager, Aaron M.
Aff4, Aff5, Aff9
Warth, Richard
Rainey, William E.
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Pan-cancer proteogenomics characterization of tumor immunity
학술저널
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In
Cell
29 February 2024 187(5):1255-1277
Author
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Akiyama, Yo
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Anurag, Meenakshi
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Chinnaiyan, Arul M.
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Ji, Jiayi
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Kolodziejczak, Iga
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Kumar
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Sinha
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Chandan
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Liao, Yuxing
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Liu, Tao
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Schraink, Tobias
Schürer, Stephan
Shi, Zhiao
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Song, Feng
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Tan, Jimin
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Zhang, Qing
Zhang, Xu
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Caruso, Francesca Pia
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Calinawan, Anna
Evangelista, John Erol
Selvan, Myvizhi Esai
Chowdhury, Shrabanti
Rykunov, Dmitry
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Song, Xiaoyu
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Christianson, Karen E.
Lewis, David A.
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Yi, Xinpei
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Wang, Ying
Wiznerowicz, Maciej
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Iavarone, Antonio
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Robles, Ana I.
Nesvizhskii, Alexey I.
Mani, D.R.
Gillette, Michael A.
Klein, Robert J.
Cieslik, Marcin
Zhang, Bing
Paulovich, Amanda G.
Sebra, Robert
Gümüş, Zeynep H.
Hostetter, Galen
Fenyö, David
Omenn, Gilbert S.
Cantley, Lewis C.
Ma'ayan, Avi
Lazar, Alexander J.
Ceccarelli, Michele
Wang, Pei
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6
Deep learning integrates histopathology and proteogenomics at a pan-cancer level
학술저널
issue
In
Cell Reports Medicine
19 September 2023 4(9)
Author
Aguet, François
Akiyama, Yo
Anand, Shankara
Anurag, Meenakshi
Babur, Özgün
Bavarva, Jasmin
Birger, Chet
Birrer, Michael J.
Cantley, Lewis C.
Cao, Song
Carr, Steven A.
Ceccarelli, Michele
Chan, Daniel W.
Chinnaiyan, Arul M.
Cho, Hanbyul
Chowdhury, Shrabanti
Cieslik, Marcin P.
Clauser, Karl R.
Colaprico, Antonio
Zhou, Daniel Cui
da Veiga Leprevost, Felipe
Day, Corbin
Dhanasekaran, Saravana M.
Domagalski, Marcin J.
Dou, Yongchao
Druker, Brian J.
Edwards, Nathan
Ellis, Matthew J.
Selvan, Myvizhi Esai
Foltz, Steven M.
Francis, Alicia
Geffen, Yifat
Getz, Gad
Gonzalez Robles, Tania J.
Gosline, Sara J.C.
Gümüş, Zeynep H.
Heiman, David I.
Hiltke, Tara
Hostetter, Galen
Hu, Yingwei
Huang, Chen
Huntsman, Emily
Iavarone, Antonio
Jaehnig, Eric J.
Jewell, Scott D.
Ji, Jiayi
Jiang, Wen
Johnson, Jared L.
Katsnelson, Lizabeth
Ketchum, Karen A.
Kolodziejczak, Iga
Krug, Karsten
Kumar
-
Sinha
,
Chandan
Lei, Jonathan T.
Liang, Wen-Wei
Liao, Yuxing
Lindgren, Caleb M.
Liu, Tao
Ma, Weiping
Rodrigues, Fernanda Martins
McKerrow, Wilson
Mesri, Mehdi
Nesvizhskii, Alexey I.
Newton, Chelsea J.
Oldroyd, Robert
Paulovich, Amanda G.
Payne, Samuel H.
Petralia, Francesca
Pugliese, Pietro
Reva, Boris
Rykunov, Dmitry
Satpathy, Shankha
Savage, Sara R.
Schadt, Eric E.
Schnaubelt, Michael
Schürer, Stephan
Shi, Zhiao
Smith, Richard D.
Song, Xiaoyu
Song, Yizhe
Stathias, Vasileios
Storrs, Erik P.
Terekhanova, Nadezhda V.
Thangudu, Ratna R.
Thiagarajan, Mathangi
Tignor, Nicole
Wang, Liang-Bo
Wang, Pei
Wang, Ying
Wen, Bo
Wiznerowicz, Maciej
Wu, Yige
Wyczalkowski, Matthew A.
Yao, Lijun
Yaron, Tomer M.
Yi, Xinpei
Zhang, Bing
Zhang, Hui
Zhang, Qing
Zhang, Xu
Zhang, Zhen
Wang, Joshua M.
Hong, Runyu
Demicco, Elizabeth G.
Tan, Jimin
Lazcano, Rossana
Moreira, Andre L.
Li, Yize
Calinawan, Anna
Razavian, Narges
Schraink, Tobias
Gillette, Michael A.
Omenn, Gilbert S.
An, Eunkyung
Rodriguez, Henry
Tsirigos, Aristotelis
Ruggles, Kelly V.
Ding, Li
Robles, Ana I.
Mani, D.R.
Rodland, Karin D.
Lazar, Alexander J.
Liu, Wenke
Fenyö, David
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7
Proteogenomic insights suggest druggable pathways in endometrial carcinoma
학술저널
issue
In
Cancer Cell
11 September 2023 41(9):1586-1605
Author
Antczak, Andrzej
Anurag, Meenakshi
Bauer, Thomas
Birger, Chet
Birrer, Michael J.
Borucki, Melissa
Cai, Shuang
Calinawan, Anna
Carr, Steven A.
Castro, Patricia
Cerda, Sandra
Chan, Daniel W.
Chesla, David
Cieslik, Marcin P.
Cottingham, Sandra
Dhir, Rajiv
Domagalski, Marcin J.
Druker, Brian J.
Duffy, Elizabeth
Edwards, Nathan J.
Edwards, Robert
Ellis, Matthew J.
Eschbacher, Jennifer
Fam, Mina
Fevrier-Sullivan, Brenda
Francis, Jesse
Freymann, John
Gabriel, Stacey
Getz, Gad
Gillette, Michael A.
Godwin, Andrew K.
Goldthwaite, Charles A.
Grady, Pamela
Hafron, Jason
Hariharan, Pushpa
Hindenach, Barbara
Hoadley, Katherine A.
Huang, Jasmine
Ittmann, Michael M.
Johnson, Ashlie
Jones, Corbin D.
Ketchum, Karen A.
Kirby, Justin
Le, Toan
Ma'ayan, Avi
Madan, Rashna
Mareedu, Sailaja
McGarvey, Peter B.
Modugno, Francesmary
Montgomery, Rebecca
Nyce, Kristen
Paulovich, Amanda G.
Pruetz, Barbara L.
Qi, Liqun
Richey, Shannon
Schadt, Eric E.
Shutack, Yvonne
Singh, Shilpi
Smith, Michael
Tansil, Darlene
Thangudu, Ratna R.
Tobin, Matt
Um, Ki Sung
Vatanian, Negin
Webster, Alex
Wilson, George D.
Wright, Jason
Zaalishvili, Kakhaber
Zhang, Zhen
Zhao, Grace
Dou, Yongchao
Katsnelson, Lizabeth
Gritsenko, Marina A.
Hu, Yingwei
Reva, Boris
Hong, Runyu
Wang, Yi-Ting
Kolodziejczak, Iga
Lu, Rita Jui-Hsien
Tsai, Chia-Feng
Bu, Wen
Liu, Wenke
Guo, Xiaofang
An, Eunkyung
Arend, Rebecca C.
Bavarva, Jasmin
Chen, Lijun
Chu, Rosalie K.
Czekański, Andrzej
Davoli, Teresa
Demicco, Elizabeth G.
DeLair, Deborah
Devereaux, Kelly
Dhanasekaran, Saravana M.
Dottino, Peter
Dover, Bailee
Fillmore, Thomas L.
Foxall, McKenzie
Hermann, Catherine E.
Hiltke, Tara
Hostetter, Galen
Jędryka, Marcin
Jewell, Scott D.
Johnson, Isabelle
Kahn, Andrea G.
Ku, Amy T.
Kumar
-
Sinha
,
Chandan
Kurzawa, Paweł
Lazar, Alexander J.
Lazcano, Rossana
Lei, Jonathan T.
Li, Yi
Liao, Yuxing
Lih, Tung-Shing M.
Lin, Tai-Tu
Martignetti, John A.
Masand, Ramya P.
Matkowski, Rafał
McKerrow, Wilson
Mesri, Mehdi
Monroe, Matthew E.
Moon, Jamie
Moore, Ronald J.
Nestor, Michael D.
Newton, Chelsea
Omelchenko, Tatiana
Omenn, Gilbert S.
Payne, Samuel H.
Petyuk, Vladislav A.
Robles, Ana I.
Rodriguez, Henry
Ruggles, Kelly V.
Rykunov, Dmitry
Savage, Sara R.
Schepmoes, Athena A.
Shi, Tujin
Shi, Zhiao
Tan, Jimin
Taylor, Mason
Thiagarajan, Mathangi
Wang, Joshua M.
Weitz, Karl K.
Wen, Bo
Williams, C.M.
Wu, Yige
Wyczalkowski, Matthew A.
Yi, Xinpei
Zhang, Xu
Zhao, Rui
Mutch, David
Chinnaiyan, Arul M.
Smith, Richard D.
Nesvizhskii, Alexey I.
Wang, Pei
Wiznerowicz, Maciej
Ding, Li
Mani, D.R.
Zhang, Hui
Anderson, Matthew L.
Rodland, Karin D.
Zhang, Bing
Liu, Tao
Fenyö, David
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8
Integrative multi-omic cancer profiling reveals DNA methylation patterns associated with therapeutic vulnerability and cell-of-origin
학술저널
issue
In
Cancer Cell
11 September 2023 41(9):1567-1585
Author
Aguet, François
Akiyama, Yo
An, Eunkyung
Anand, Shankara
Anurag, Meenakshi
Babur, Ozgun
Bavarva, Jasmin
Birger, Chet
Birrer, Michael
Calinawan, Anna
Cantley, Lewis C.
Cao, Song
Carr, Steve
Ceccarelli, Michele
Chan, Daniel
Chinnaiyan, Arul
Cho, Hanbyul
Chowdhury, Shrabanti
Cieslik, Marcin
Clauser, Karl
Colaprico, Antonio
Zhou, Daniel Cui
da Veiga Leprevost, Felipe
Day, Corbin
Dhanasekaran, Mohan
Domagalski, Marcin
Dou, Yongchao
Druker, Brian
Edwards, Nathan
Ellis, Matthew
Selvan, Myvizhi Esai
Francis, Alicia
Getz, Gad
Gillette, Michael A.
Robles, Tania Gonzalez
Gosline, Sara
Gümüş, Zeynep
Heiman, David
Hiltke, Tara
Hong, Runyu
Hostetter, Galen
Hu, Yingwei
Huang, Chen
Huntsman, Emily
Iavarone, Antonio
Jaehnig, Eric
Jewel, Scott
Ji, Jiayi
Jiang, Wen
Lee Johnson, Jared
Katsnelson, Lizabeth
Ketchum, Karen
Krug, Karsten
Kumar
-
Sinha
,
Chandan
Lei, Jonathan
Liao, Yuxing
Lindgren, Caleb
Liu, Tao
Liu, Wenke
Ma, Weiping
Rodrigues, Fernanda Martins
McKerrow, Wilson
Mesri, Mehdi
Nesvizhskii, Alexey I.
Newton, Chelsea
Oldroyd, Robert
Omenn, Gilbert
Paulovich, Amanda
Petralia, Francesca
Pugliese, Pietro
Reva, Boris
Ruggles, Kelly
Rykunov, Dmitry
Satpathy, Shankha
Savage, Sara
Schadt, Eric
Schnaubelt, Michael
Schraink, Tobias
Shi, Zhiao
Smith, Dick
Song, Xiaoyu
Stathias, Vasileios
Storrs, Erik
Tan, Jimin
Terekhanova, Nadezhda
Thangudu, Ratna
Thiagarajan, Mathangi
Tignor, Nicole
Wang, Joshua
Wang, Liang-Bo
Wang, Pei
Wang, Ying (Cindy)
Wen, Bo
Wu, Yige
Yao, Lijun
Yaron, Tomer M.
Yi, Xinpei
Zhang, Bing
Zhang, Hui
Zhang, Qing
Zhang, Xu
Zhang, Zhen
Chan, Daniel W.
Dhanasekaran, Saravana M.
Schürer, Stephan
Smith, Richard D.
Wyczalkowski, Matthew A.
Liang, Wen-Wei
Lu, Rita Jui-Hsien
Jayasinghe, Reyka G.
Foltz, Steven M.
Porta-Pardo, Eduard
Geffen, Yifat
Wendl, Michael C.
Lazcano, Rossana
Kolodziejczak, Iga
Song, Yizhe
Govindan, Akshay
Demicco, Elizabeth G.
Li, Xiang
Li, Yize
Sethuraman, Sunantha
Payne, Samuel H.
Fenyö, David
Rodriguez, Henry
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Lazar, Alexander J.
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9
Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis
학술저널
issue
In
Cancer Cell
14 August 2023 41(8):1397-1406
Author
Lazar, Alexander J.
Paulovich, Amanda G.
Colaprico, Antonio
Iavarone, Antonio
Chinnaiyan, Arul M.
Druker, Brian J.
Kumar
-
Sinha
,
Chandan
Newton, Chelsea J.
Huang, Chen
Mani, D.R.
Smith, Richard D.
Huntsman, Emily
Schadt, Eric E.
An, Eunkyung
Petralia, Francesca
Hostetter, Galen
Omenn, Gilbert S.
Cho, Hanbyul
Rodriguez, Henry
Zhang, Hui
Kolodziejczak, Iga
Johnson, Jared L.
Bavarva, Jasmin
Tan, Jimin
Rodland, Karin D.
Clauser, Karl R.
Krug, Karsten
Cantley, Lewis C.
Wiznerowicz, Maciej
Ellis, Matthew J.
Anurag, Meenakshi
Mesri, Mehdi
Gillette, Michael A.
Birrer, Michael J.
Ceccarelli, Michele
Dhanasekaran, Saravana M.
Edwards, Nathan
Tignor, Nicole
Babur, Özgün
Pugliese, Pietro
Gosline, Sara J.C.
Jewell, Scott D.
Satpathy, Shankha
Chowdhury, Shrabanti
Schürer, Stephan
Carr, Steven A.
Liu, Tao
Hiltke, Tara
Yaron, Tomer M.
Stathias, Vasileios
Liu, Wenke
Zhang, Xu
Song, Yizhe
Zhang, Zhen
Li, Yize
Dou, Yongchao
Da Veiga Leprevost, Felipe
Geffen, Yifat
Calinawan, Anna P.
Aguet, François
Akiyama, Yo
Anand, Shankara
Birger, Chet
Cao, Song
Chaudhary, Rekha
Chilappagari, Padmini
Cieslik, Marcin
Zhou, Daniel Cui
Day, Corbin
Domagalski, Marcin J.
Esai Selvan, Myvizhi
Fenyö, David
Foltz, Steven M.
Francis, Alicia
Gonzalez-Robles, Tania
Gümüş, Zeynep H.
Heiman, David
Holck, Michael
Hong, Runyu
Hu, Yingwei
Jaehnig, Eric J.
Ji, Jiayi
Jiang, Wen
Katsnelson, Lizabeth
Ketchum, Karen A.
Klein, Robert J.
Lei, Jonathan T.
Liang, Wen-Wei
Liao, Yuxing
Lindgren, Caleb M.
Ma, Weiping
Ma, Lei
MacCoss, Michael J.
Martins Rodrigues, Fernanda
McKerrow, Wilson
Nguyen, Ngoc
Oldroyd, Robert
Pilozzi, Alexander
Reva, Boris
Rudnick, Paul
Ruggles, Kelly V.
Rykunov, Dmitry
Savage, Sara R.
Schnaubelt, Michael
Schraink, Tobias
Shi, Zhiao
Singhal, Deepak
Song, Xiaoyu
Storrs, Erik
Terekhanova, Nadezhda V.
Thangudu, Ratna R.
Thiagarajan, Mathangi
Wang, Liang-Bo
Wang, Joshua M.
Wang, Ying
Wen, Bo
Wu, Yige
Wyczalkowski, Matthew A.
Xin, Yi
Yao, Lijun
Yi, Xinpei
Zhang, Qing
Zuhl, Maya
Getz, Gad
Ding, Li
Nesvizhskii, Alexey I.
Wang, Pei
Robles, Ana I.
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10
Genomics driven precision oncology in advanced biliary tract cancer improves survival
학술저널
issue
In
Neoplasia
August 2023 42
Author
Kumar
-
Sinha
,
Chandan
Vats, Pankaj
Tran, Nguyen
Robinson, Dan R.
Gunchick, Valerie
Wu, Yi-Mi
Cao, Xuhong
Ning, Yu
Wang, Rui
Rabban, Erica
Bell, Janice
Shankar, Sunita
Mannan, Rahul
Zhang, Yuping
Zalupski, Mark M.
Chinnaiyan, Arul M.
Sahai, Vaibhav
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