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Enhanced clinical assessment of hematologic malignancies through routine paired tumor and normal sequencing
학술저널
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Nature Communications
. 14(1)
Author
Ptashkin, Ryan N.
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Ewalt, Mark D.
Aff1, IDs41467023425859_cor2
Jayakumaran, Gowtham
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Wang, Jiajing
Liu, Ying
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Borsu, Laetitia
Zhang, Yanming
Aypar, Umut
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Park, Jae H.
Abdel-Wahab, Omar
Aff2, Aff4
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Yabe, Mariko
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Giralt, Sergio
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Rampal, Raajit
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Aff2, Aff4
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Aff4, Aff5
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Aff2, Aff4
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Ladanyi, Marc
Berger, Michael F.
Aff1, Aff2
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Arcila, Maria E.
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GA4GH: International policies and standards for data sharing across genomic research and healthcare
학술저널
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Cell Genomics
. 1(2)
Author
Rehm, Heidi L
Page, Angela JH
Smith, Lindsay
Adams, Jeremy B
Alterovitz, Gil
Babb, Lawrence J
Barkley, Maxmillian P
Baudis, Michael
Beauvais, Michael JS
Beck, Tim
Beckmann, Jacques S
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Bernick, David
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Bourque, Guillaume
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Brookes, Anthony J
Brudno, Michael
Brush, Matthew H
Bujold, David
Burdett, Tony
Buske, Orion J
Cabili, Moran N
Cameron, Daniel L
Carroll, Robert J
Casas-Silva, Esmeralda
Chakravarty
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Chen, Shu Hui
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Cook-Deegan, Robert M
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Davies, Robert M
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Doerr, Megan J
Dolman, Lena I
Dove, Edward S
Dursi, L Jonathan
Dyke, Stephanie OM
Eddy, James A
Eilbeck, Karen
Ellrott, Kyle P
Fairley, Susan
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Gan, Weiniu
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Guigó, Roderic
Gupta, Dipayan
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Jones, Steven JM
Kanitz, Alexander
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Keane, Thomas M
Kekesi-Lafrance, Kristina
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Tumor sequencing of African ancestry reveals differences in clinically relevant alterations across common cancers
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13 November 2023 41(11):1963-1971
Author
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Jin, Dexter X.
Newberg, Justin Y.
Perea-Chamblee, Tomin
Pekala, Kelly R.
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Maund, Sophia L.
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Overall survival with circulating tumor DNA-guided therapy in advanced non-small-cell lung cancer
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Nature Medicine
. 28(11):2353-2363
Author
Jee, Justin
Lebow, Emily S.
Yeh, Randy
Das, Jeeban P.
Namakydoust, Azadeh
Paik, Paul K.
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Schultz, Nikolaus
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Murciano-Goroff, Yonina R.
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Wilhelm, Clare
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Kris, Mark G.
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Eng, Juliana
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Berger, Michael F.
Arcila, Maria E.
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Ladanyi, Marc
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Levine, Ross L.
Aff1, Aff2
Shen, Ronglai
Razavi, Pedram
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Reis-Filho, Jorge S.
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Jones, David R.
Aff1, Aff2
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Base editing sensor libraries for high-throughput engineering and functional analysis of cancer-associated single nucleotide variants
학술저널
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Nature Biotechnology: The Science and Business of Biotechnology
. 40(6):862-873
Author
Sánchez-Rivera, Francisco J.
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Diaz, Bianca J.
Aff2, Aff3
Kastenhuber, Edward R.
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Katti, Alyna
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Kennedy, Margaret
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Tem, Vincent
Ho, Yu-Jui
Leibold, Josef
Aff1, Aff12, Aff13
Paffenholz, Stella V.
Aff1, Aff4
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Goswami, Sukanya
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Tsanov, Kaloyan M.
Chakravarty
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Debyani
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Leslie, Christina S.
Lowe, Scott W.
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AKT mutant allele-specific activation dictates pharmacologic sensitivities
학술저널
issue
Nature Communications
. 13(1)
Author
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Shamu, Tambudzai
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Gorelick, Alexander N.
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Chang, Matthew T.
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Debyani
Gavrila, Elena I.
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Donoghue, Mark T. A.
Gao, JianJong
Patel, Swati
Gao, Sizhi Paul
Reynolds, Margaret H.
Phillips, Sarah M.
Soumerai, Tara
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Abida, Wassim
Hyman, David M.
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Schram, Alison M.
Solit, David B.
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Smyth, Lillian M.
Aff4, Aff6
Taylor, Barry S.
Aff1, Aff2, Aff3, Aff5, Aff6, IDs41467022296381_cor19
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Interpreting and integrating genomic tests results in clinical cancer care: Overview and practical guidance
학술저널
issue
CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS
; JAN 4 2024, 22p.
Author
Casolino, Raffaella
Beer, Philip A.
Chakravarty
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Debyani
Davis, Melissa B.
Malapelle, Umberto
Mazzarella, Luca
Normanno, Nicola
Pauli, Chantal
Subbiah, Vivek
Turnbull, Clare
Westphalen, C. Benedikt
Biankin, Andrew V.
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Precision Oncology: 2023 in Review
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issue
CANCER DISCOVERY
; DEC 12 2023, 13 12, p2525-p2531, 7p.
Author
Murciano-Goroff, Yonina R.
Suehnholz, Sarah P.
Drilon, Alexander
Chakravarty
,
Debyani
DB Label
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9
Standards for the classification of pathogenicity of somatic variants in cancer (oncogenicity): Joint recommendations of Clinical Genome Resource (ClinGen), Cancer Genomics Consortium (CGC), and Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
학술저널
issue
In
Genetics in Medicine
May 2022 24(5):986-998
Author
Horak, Peter
Griffith, Malachi
Danos, Arpad M.
Pitel, Beth A.
Madhavan, Subha
Liu, Xuelu
Chow, Cynthia
Williams, Heather
Carmody, Leigh
Barrow-Laing, Lisa
Rieke, Damian
Kreutzfeldt, Simon
Stenzinger, Albrecht
Tamborero, David
Benary, Manuela
Rajagopal, Padma Sheila
Ida, Cristiane M.
Lesmana, Harry
Satgunaseelan, Laveniya
Merker, Jason D.
Tolstorukov, Michael Y.
Campregher, Paulo Vidal
Warner, Jeremy L.
Rao, Shruti
Natesan, Maya
Shen, Haolin
Venstrom, Jeffrey
Roy, Somak
Tao, Kayoko
Kanagal-Shamanna, Rashmi
Xu, Xinjie
Ritter, Deborah I.
Pagel, Kym
Krysiak, Kilannin
Dubuc, Adrian
Akkari, Yassmine M.
Li, Xuan Shirley
Lee, Jennifer
King, Ian
Raca, Gordana
Wagner, Alex H.
Li, Marylin M.
Plon, Sharon E.
Kulkarni, Shashikant
Griffith, Obi L.
Chakravarty
,
Debyani
Sonkin, Dmitriy
DB Label
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10
Pan-Cancer Analysis of lncRNA Regulation Supports Their Targeting of Cancer Genes in Each Tumor Context
학술저널
issue
Cell Reports
. 23(1)
Author
Chiu, Hua-Sheng
Somvanshi, Sonal
Patel, Ektaben
Chen, Ting-Wen
Singh, Vivek P
Zorman, Barry
Patil, Sagar L
Pan, Yinghong
Chatterjee, Sujash S
Network, The Cancer Genome Atlas Research
Caesar-Johnson, Samantha J
Demchok, John A
Felau, Ina
Kasapi, Melpomeni
Ferguson, Martin L
Hutter, Carolyn M
Sofia, Heidi J
Tarnuzzer, Roy
Wang, Zhining
Yang, Liming
Zenklusen, Jean C
Zhang, Jiashan
Chudamani, Sudha
Liu, Jia
Lolla, Laxmi
Naresh, Rashi
Pihl, Todd
Sun, Qiang
Wan, Yunhu
Wu, Ye
Cho, Juok
DeFreitas, Timothy
Frazer, Scott
Gehlenborg, Nils
Getz, Gad
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Kim, Jaegil
Lawrence, Michael S
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Meier, Sam
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Chakravarty
,
Debyani
Chatila, Walid K
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Gao, Jianjiong
Gross, Benjamin E
Heins, Zachary J
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Phillips, Sarah M
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Zhang, Hongxin
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