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Genomic surveillance reveals dynamic shifts in the connectivity of COVID-19 epidemics
학술저널
Author
Matteson, Nathaniel L
Hassler, Gabriel W
Kurzban, Ezra
Schwab, Madison A
Perkins, Sarah A
Gangavarapu, Karthik
Levy, Joshua I
Parker
,
Edyth
Pride, David
Hakim, Abbas
De Hoff, Peter
Cheung, Willi
Castro-Martinez, Anelizze
Rivera, Andrea
Veder, Anthony
Rivera, Ariana
Wauer, Cassandra
Holmes, Jacqueline
Wilson, Jedediah
Ngo, Shayla N
Plascencia, Ashley
Lawrence, Elijah S
Smoot, Elizabeth W
Eisner, Emily R
Tsai, Rebecca
Chacón, Marisol
Baer, Nathan A
Seaver, Phoebe
Salido, Rodolfo A
Aigner, Stefan
Ngo, Toan T
Barber, Tom
Ostrander, Tyler
Fielding-Miller, Rebecca
Simmons, Elizabeth H
Zazueta, Oscar E
Serafin-Higuera, Idanya
Sanchez-Alavez, Manuel
Moreno-Camacho, Jose L
García-Gil, Abraham
Schafer, Ashleigh R Murphy
McDonald, Eric
Corrigan, Jeremy
Malone, John D
Stous, Sarah
Shah, Seema
Moshiri, Niema
Weiss, Alana
Anderson, Catelyn
Aceves, Christine M
Spencer, Emily G
Hufbauer, Emory C
Lee, Justin J
Ramesh, Karthik S
Nguyen, Kelly N
Saucedo, Kieran
Robles-Sikisaka, Refugio
Fisch, Kathleen M
Gonias, Steven L
Birmingham, Amanda
McDonald, Daniel
Karthikeyan, Smruthi
Martin, Natasha K
Schooley, Robert T
Negrete, Agustin J
Reyna, Horacio J
Chavez, Jose R
Garcia, Maria L
Cornejo-Bravo, Jose M
Becker, David
Isaksson, Magnus
Washington, Nicole L
Lee, William
Garfein, Richard S
Esparza, Marco A Luna-Ruiz
Alcántar-Fernández, Jonathan
Henson, Benjamin
Jepsen, Kristen
Olivares-Flores, Beatriz
Barrera-Badillo, Gisela
Lopez-Martínez, Irma
Ramírez-González, José E
Flores-León, Rita
Kingsmore, Stephen F
Sanders, Alison
Pradenas, Allorah
White, Benjamin
Matthews, Gary
Hale, Matt
McLawhon, Ronald W
Reed, Sharon L
Winbush, Terri
McHardy, Ian H
Fielding, Russel A
Nicholson, Laura
Quigley, Michael M
Harding, Aaron
Mendoza, Art
Bakhtar, Omid
Browne, Sara H
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
2
Introduction and Establishment of SARS-CoV-2 Gamma Variant in New York City in Early 2021
학술저널
issue
The Journal of Infectious Diseases
. 226(12)
Author
Vasylyeva, Tetyana I
Fang, Courtney E
Su, Michelle
Havens, Jennifer L
Parker
,
Edyth
Wang, Jade C
Zeller, Mark
Yakovleva, Anna
Hassler, Gabriel W
Chowdhury, Moinuddin A
Andersen, Kristian G
Hughes, Scott
Wertheim, Joel O
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
3
Wastewater sequencing reveals early cryptic SARS-CoV-2 variant transmission
학술저널
issue
Nature
. 609(7925)
Author
Karthikeyan, Smruthi
Levy, Joshua I
De Hoff, Peter
Humphrey, Greg
Birmingham, Amanda
Jepsen, Kristen
Farmer, Sawyer
Tubb, Helena M
Valles, Tommy
Tribelhorn, Caitlin E
Tsai, Rebecca
Aigner, Stefan
Sathe, Shashank
Moshiri, Niema
Henson, Benjamin
Mark, Adam M
Hakim, Abbas
Baer, Nathan A
Barber, Tom
Belda-Ferre, Pedro
Chacón, Marisol
Cheung, Willi
Cresini, Evelyn S
Eisner, Emily R
Lastrella, Alma L
Lawrence, Elijah S
Marotz, Clarisse A
Ngo, Toan T
Ostrander, Tyler
Plascencia, Ashley
Salido, Rodolfo A
Seaver, Phoebe
Smoot, Elizabeth W
McDonald, Daniel
Neuhard, Robert M
Scioscia, Angela L
Satterlund, Alysson M
Simmons, Elizabeth H
Abelman, Dismas B
Brenner, David
Bruner, Judith C
Buckley, Anne
Ellison, Michael
Gattas, Jeffrey
Gonias, Steven L
Hale, Matt
Hawkins, Faith
Ikeda, Lydia
Jhaveri, Hemlata
Johnson, Ted
Kellen, Vince
Kremer, Brendan
Matthews, Gary
McLawhon, Ronald W
Ouillet, Pierre
Park, Daniel
Pradenas, Allorah
Reed, Sharon
Riggs, Lindsay
Sanders, Alison
Sollenberger, Bradley
Song, Angela
White, Benjamin
Winbush, Terri
Aceves, Christine M
Anderson, Catelyn
Gangavarapu, Karthik
Hufbauer, Emory
Kurzban, Ezra
Lee, Justin
Matteson, Nathaniel L
Parker
,
Edyth
Perkins, Sarah A
Ramesh, Karthik S
Robles-Sikisaka, Refugio
Schwab, Madison A
Spencer, Emily
Wohl, Shirlee
Nicholson, Laura
McHardy, Ian H
Dimmock, David P
Hobbs, Charlotte A
Bakhtar, Omid
Harding, Aaron
Mendoza, Art
Bolze, Alexandre
Becker, David
Cirulli, Elizabeth T
Isaksson, Magnus
Schiabor Barrett, Kelly M
Washington, Nicole L
Malone, John D
Schafer, Ashleigh Murphy
Gurfield, Nikos
Stous, Sarah
Fielding-Miller, Rebecca
Garfein, Richard S
Gaines, Tommi
Anderson, Cheryl
Martin, Natasha K
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
4
Emergence and spread of two SARS-CoV-2 variants of interest in Nigeria
학술저널
issue
Nature Communications
. 14(1)
Author
Olawoye, Idowu B.
Aff1, Aff2
Oluniyi, Paul E.
Aff1, Aff2
Oguzie, Judith U.
Aff1, Aff2
Uwanibe, Jessica N.
Aff1, Aff2
Kayode, Tolulope A.
Aff1, Aff2
Olumade, Testimony J.
Aff1, Aff2
Ajogbasile, Fehintola V.
Aff1, Aff2
Parker
,
Edyth
Eromon, Philomena E.
Abechi, Priscilla
Aff1, Aff2
Sobajo, Tope A.
Aff1, Aff2
Ugwu, Chinedu A.
Aff1, Aff2
George, Uwem E.
Aff1, Aff2
Ayoade, Femi
Aff1, Aff2
Akano, Kazeem
Aff1, Aff2
Oyejide, Nicholas E.
Nosamiefan, Iguosadolo
Fred-Akintunwa, Iyanuoluwa
Adedotun-Sulaiman, Kemi
Brimmo, Farida B.
Adegboyega, Babatunde B.
Philip, Courage
Adeleke, Richard A.
Chukwu, Grace C.
Ahmed, Muhammad I.
Ope-Ewe, Oludayo O.
Otitoola, Shobi G.
Ogunsanya, Olusola A.
Saibu, Mudasiru F.
Sijuwola, Ayotunde E.
Ezekiel, Grace O.
John, Oluwagboadurami G.
Aff1, Aff2
Akin-John, Julie O.
Aff1, Aff2
Akinlo, Oluwasemilogo O.
Fayemi, Olanrewaju O.
Ipaye, Testimony O.
Nwodo, Deborah C.
Omoniyi, Abolade E.
Omwanghe, Iyobosa B.
Terkuma, Christabel A.
Okolie, Johnson
Ayo-Ale, Olubukola
Ikponmwosa, Odia
Benevolence, Ebo
Naregose, Grace O.
Patience, Akhilomen E.
Blessing, Osiemi
Micheal, Airende
Jacqueline, Agbukor
Aiyepada, John O.
Ebhodaghe, Paulson
Racheal, Omiunu
Rita, Esumeh
Rosemary, Giwa E.
Solomon, Ehikhametalor
Anieno, Ekanem
Edna, Yerumoh
Chris, Aire O.
Donatus, Adomeh I.
Ogbaini-Emovon, Ephraim
Tatfeng, Mirabeau Y.
Omunakwe, Hannah E.
Bob-Manuel, Mienye
Ahmed, Rahaman A.
Onwuamah, Chika K.
Shaibu, Joseph O.
Okwuraiwe, Azuka
Ataga, Anthony E.
Bock-Oruma, Andrew
Daramola, Funmi
Yusuf, Ibrahim F.
Fajola, Akinwumi
Ntia, Nsikak-Abasi
Ekpo, Julie J.
Moses, Anietie E.
Moore-Igwe, Beatrice W.
Fakayode, Oluwatosin E.
Akinola, Monilade
Kida, Ibrahim M.
Oderinde, Bamidele S.
Wudiri, Zara W.
Adeyemi, Oluwapelumi O.
Akanbi, Olusola A.
Ahumibe, Anthony
Akinpelu, Afolabi
Ayansola, Oyeronke
Babatunde, Olajumoke
Omoare, Adesuyi A.
Chukwu, Chimaobi
Mba, Nwando G.
Omoruyi, Ewean C.
Olisa, Olasunkanmi
Akande, Olatunji K.
Nwafor, Ifeanyi E.
Ekeh, Matthew A.
Ndoma, Erim
Ewah, Richard L.
Duruihuoma, Rosemary O.
Abu, Augustine
Odeh, Elizabeth
Onyia, Venatius
Ojide, Chiedozie K.
Okoro, Sylvanus
Igwe, Daniel
Ogah, Emeka O.
Khan, Kamran
Aff25, Aff26
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Ugwu, Collins N.
Ukwaja, Kingsley N.
Ugwu, Ngozi I.
Abejegah, Chukwuyem
Adedosu, Nelson
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Isamotu, Rafiu O.
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Schaffner, Stephen F.
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Erameh, Cyril Oshomah
Baba, Marycelin M.
Aff16, Aff17
Oladiji, Femi
Audu, Rosemary
Ndodo, Nnaemeka
Fowotade, Adeola
Okogbenin, Sylvanus
Okokhere, Peter O.
Park, Danny J.
Mcannis, Bronwyn L.
Adetifa, Ifedayo M.
Ihekweazu, Chikwe
Salako, Babatunde L.
Tomori, Oyewale
Happi, Anise N.
Folarin, Onikepe A.
Aff1, Aff2
Andersen, Kristian G.
Sabeti, Pardis C.
Aff32, Aff34
Happi, Christian T.
Aff1, Aff2, Aff34, IDs41467023364495_cor139
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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OA (Nature)
OA (Springer)
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등재 - Web of Science (SCIE)
등재 - SCOPUS
5
The molecular epidemiology of multiple zoonotic origins of SARS-CoV-2
학술저널
issue
Science
. 377(6609)
Author
Pekar, Jonathan E
Magee, Andrew
Parker
,
Edyth
Moshiri, Niema
Izhikevich, Katherine
Havens, Jennifer L
Gangavarapu, Karthik
Malpica Serrano, Lorena Mariana
Crits-Christoph, Alexander
Matteson, Nathaniel L
Zeller, Mark
Levy, Joshua I
Wang, Jade C
Hughes, Scott
Lee, Jungmin
Park, Heedo
Park, Man-Seong
Ching Zi Yan, Katherine
Lin, Raymond Tzer Pin
Mat Isa, Mohd Noor
Noor, Yusuf Muhammad
Vasylyeva, Tetyana I
Garry, Robert F
Holmes, Edward C
Rambaut, Andrew
Suchard, Marc A
Andersen, Kristian G
Worobey, Michael
Wertheim, Joel O
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
6
Regional connectivity drove bidirectional transmission of SARS-CoV-2 in the Middle East during travel restrictions
학술저널
issue
Nature Communications
. 13(1)
Author
Parker
,
Edyth
Anderson, Catelyn
Zeller, Mark
Tibi, Ahmad
Havens, Jennifer L
Laroche, Geneviève
Benlarbi, Mehdi
Ariana, Ardeshir
Robles-Sikisaka, Refugio
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Gangavarapu, Karthik
Ramesh, Karthik
Kurzban, Ezra
Matteson, Nathaniel L
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Hughes, Laura D
McGraw, Michelle
Spencer, Emily
Nicholson, Laura
Khan, Kamran
Suchard, Marc A
Wertheim, Joel O
Wohl, Shirlee
Côté, Marceline
Abdelnour, Amid
Andersen, Kristian G
Abu-Dayyeh, Issa
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
7
Genomic surveillance reveals dynamic shifts in the connectivity of COVID-19 epidemics
학술저널
issue
In
Cell
21 December 2023 186(26):5690-5704
Author
Matteson, Nathaniel L.
Hassler, Gabriel W.
Kurzban, Ezra
Schwab, Madison A.
Perkins, Sarah A.
Gangavarapu, Karthik
Levy, Joshua I.
Parker
,
Edyth
Pride, David
Hakim, Abbas
De Hoff, Peter
Cheung, Willi
Castro-Martinez, Anelizze
Rivera, Andrea
Veder, Anthony
Rivera, Ariana
Wauer, Cassandra
Holmes, Jacqueline
Wilson, Jedediah
Ngo, Shayla N.
Plascencia, Ashley
Lawrence, Elijah S.
Smoot, Elizabeth W.
Eisner, Emily R.
Tsai, Rebecca
Chacón, Marisol
Baer, Nathan A.
Seaver, Phoebe
Salido, Rodolfo A.
Aigner, Stefan
Ngo, Toan T.
Barber, Tom
Ostrander, Tyler
Fielding-Miller, Rebecca
Simmons, Elizabeth H.
Zazueta, Oscar E.
Serafin-Higuera, Idanya
Sanchez-Alavez, Manuel
Moreno-Camacho, Jose L.
García-Gil, Abraham
Murphy Schafer, Ashleigh R.
McDonald, Eric
Corrigan, Jeremy
Malone, John D.
Stous, Sarah
Shah, Seema
Moshiri, Niema
Weiss, Alana
Anderson, Catelyn
Aceves, Christine M.
Spencer, Emily G.
Hufbauer, Emory C.
Lee, Justin J.
King, Alison J.
Ramesh, Karthik S.
Nguyen, Kelly N.
Saucedo, Kieran
Robles-Sikisaka, Refugio
Fisch, Kathleen M.
Gonias, Steven L.
Birmingham, Amanda
McDonald, Daniel
Karthikeyan, Smruthi
Martin, Natasha K.
Schooley, Robert T.
Negrete, Agustin J.
Reyna, Horacio J.
Chavez, Jose R.
Garcia, Maria L.
Cornejo-Bravo, Jose M.
Becker, David
Isaksson, Magnus
Washington, Nicole L.
Lee, William
Garfein, Richard S.
Luna-Ruiz Esparza, Marco A.
Alcántar-Fernández, Jonathan
Henson, Benjamin
Jepsen, Kristen
Olivares-Flores, Beatriz
Barrera-Badillo, Gisela
Lopez-Martínez, Irma
Ramírez-González, José E.
Flores-León, Rita
Kingsmore, Stephen F.
Sanders, Alison
Pradenas, Allorah
White, Benjamin
Matthews, Gary
Hale, Matt
McLawhon, Ronald W.
Reed, Sharon L.
Winbush, Terri
McHardy, Ian H.
Fielding, Russel A.
Nicholson, Laura
Quigley, Michael M.
Harding, Aaron
Mendoza, Art
Bakhtar, Omid
Browne, Sara H.
Olivas Flores, Jocelyn
Rincon Rodríguez, Diana G.
Gonzalez Ibarra, Martin
Robles Ibarra, Luis C.
Arellano Vera, Betsy J.
Gonzalez Garcia, Jonathan
Harvey-Vera, Alicia
Knight, Rob
Laurent, Louise C.
Yeo, Gene W.
Wertheim, Joel O.
Ji, Xiang
Worobey, Michael
Suchard, Marc A.
Andersen, Kristian G.
Campos-Romero, Abraham
Wohl, Shirlee
Zeller, Mark
DB Label
Database : ScienceDirect
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조회 - Impact Factor (JCR)
등재 - Web of Science (SCIE)
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8
Wastewater sequencing uncovers early, cryptic SARS-CoV-2 variant transmission
학술저널
Author
Karthikeyan, Smruthi
Levy, Joshua I
De Hoff, Peter
Humphrey, Greg
Birmingham, Amanda
Jepsen, Kristen
Farmer, Sawyer
Tubb, Helena M
Valles, Tommy
Tribelhorn, Caitlin E
Tsai, Rebecca
Aigner, Stefan
Sathe, Shashank
Moshiri, Niema
Henson, Benjamin
Mark, Adam M
Hakim, Abbas
Baer, Nathan A
Barber, Tom
Belda-Ferre, Pedro
Chacón, Marisol
Cheung, Willi
Cresini, Evelyn S
Eisner, Emily R
Lastrella, Alma L
Lawrence, Elijah S
Marotz, Clarisse A
Ngo, Toan T
Ostrander, Tyler
Plascencia, Ashley
Salido, Rodolfo A
Seaver, Phoebe
Smoot, Elizabeth W
McDonald, Daniel
Neuhard, Robert M
Scioscia, Angela L
Satterlund, Alysson M
Simmons, Elizabeth H
Abelman, Dismas B
Brenner, David
Bruner, Judith C
Buckley, Anne
Ellison, Michael
Gattas, Jeffrey
Gonias, Steven L
Hale, Matt
Hawkins, Faith
Ikeda, Lydia
Jhaveri, Hemlata
Johnson, Ted
Kellen, Vince
Kremer, Brendan
Matthews, Gary
McLawhon, Ronald W
Ouillet, Pierre
Park, Daniel
Pradenas, Allorah
Reed, Sharon
Riggs, Lindsay
Sanders, Alison
Sollenberger, Bradley
Song, Angela
White, Benjamin
Winbush, Terri
Aceves, Christine M
Anderson, Catelyn
Gangavarapu, Karthik
Hufbauer, Emory
Kurzban, Ezra
Lee, Justin
Matteson, Nathaniel L
Parker
,
Edyth
Perkins, Sarah A
Ramesh, Karthik S
Robles-Sikisaka, Refugio
Schwab, Madison A
Spencer, Emily
Wohl, Shirlee
Nicholson, Laura
Mchardy, Ian H
Dimmock, David P
Hobbs, Charlotte A
Bakhtar, Omid
Harding, Aaron
Mendoza, Art
Bolze, Alexandre
Becker, David
Cirulli, Elizabeth T
Isaksson, Magnus
Barrett, Kelly M Schiabor
Washington, Nicole L
Malone, John D
Schafer, Ashleigh Murphy
Gurfield, Nikos
Stous, Sarah
Fielding-Miller, Rebecca
Garfein, Richard S
Gaines, Tommi
Anderson, Cheryl
Martin, Natasha K
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
9
SARS-CoV-2 diagnostic testing rates determine the sensitivity of genomic surveillance programs
학술저널
issue
Nature Genetics
. 55(1):26-33
Author
Han, Alvin X.
Aff1, IDs4158802201267w_cor1
Toporowski, Amy
Sacks, Jilian A.
Perkins, Mark D.
Briand, Sylvie
van Kerkhove, Maria
Hannay, Emma
Carmona, Sergio
Rodriguez, Bill
Parker
,
Edyth
Nichols, Brooke E.
Aff1, Aff2, Aff5
Russell, Colin A.
Aff1, Aff5, IDs4158802201267w_cor12
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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Full Text (Nature)
조회 - Impact Factor (JCR)
등재 - Web of Science (SCIE)
등재 - SCOPUS
10
Phylogenetic approaches for quantifying the genotypic diversity of influenza viruses
학위논문
Author
Parker
,
Edyth
DB Label
Database : British Library EThOS
1
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93530
127318029
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