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PolyGR and polyPR knock-in mice reveal a conserved neuroprotective extracellular matrix signature in C9orf72 ALS/FTD neurons
학술저널
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Nature Neuroscience
. 27(4):643-655
Author
Milioto, Carmelo
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Carcolé, Mireia
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Giblin, Ashling
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Coneys, Rachel
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Attrebi, Olivia
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Greensmith, Linda
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Aff4, Aff15, IDs41593024015894_cor39
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The complete sequence of a human Y chromosome
학술저널
issue
Nature: International weekly journal of science
. 621(7978):344-354
Author
Rhie, Arang
Nurk, Sergey
Aff1, Aff51
Cechova, Monika
Aff2, Aff3
Hoyt, Savannah J.
Taylor, Dylan J.
Altemose, Nicolas
Hook, Paul W.
Koren, Sergey
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Allen, Jamie
Asri, Mobin
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Chen, Nae-Chyun
Chin, Chen-Shan
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Formenti, Giulio
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Garcia Giron, Carlos
Garrison, Erik
Gershman, Ariel
Gerton, Jennifer L.
Aff20, Aff21
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Guarracino, Andrea
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Halabian, Reza
Hansen, Nancy F.
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Hartley, Gabrielle A.
Harvey, William T.
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Hubley, Robert M.
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Martin, Fergal J.
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McNulty, Brandy M.
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Mikheenko
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Alla
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Olsen, Hugh E.
Aff3, Aff11
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Paulin, Luis F.
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Salzberg, Steven L.
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Shumate, Alaina
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Surapaneni, Likhitha
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Tomaszkiewicz, Marta
Aff25, Aff46
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Watwood, Allison C.
Weissensteiner, Matthias H.
Wenger, Aaron M.
Wilson, Melissa A.
Zarate, Samantha
Zhu, Yiming
Zook, Justin M.
Eichler, Evan E.
Aff26, Aff48
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Aff4, Aff49, Aff50
Schatz, Michael C.
Aff5, Aff13
Miga, Karen H.
Aff3, Aff11
Makova, Kateryna D.
Phillippy, Adam M.
Aff1, IDs4158602306457y_cor87
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Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads
학술저널
issue
Nature Biotechnology: The Science and Business of Biotechnology
. 41(7):915-918
Author
Prjibelski, Andrey D.
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Mikheenko
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Smetanin, Alexander
Jarroux, Julien
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Alla
L.
Tilgner, Hagen U.
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Complete genomic and epigenetic maps of human centromeres
학술저널
issue
Science
. 376(6588)
Author
Altemose, Nicolas
Logsdon, Glennis A
Bzikadze, Andrey V
Sidhwani, Pragya
Langley, Sasha A
Caldas, Gina V
Hoyt, Savannah J
Uralsky, Lev
Ryabov, Fedor D
Shew, Colin J
Sauria, Michael EG
Borchers, Matthew
Gershman, Ariel
Mikheenko
,
Alla
Shepelev, Valery A
Dvorkina, Tatiana
Kunyavskaya, Olga
Vollger, Mitchell R
Rhie, Arang
McCartney, Ann M
Asri, Mobin
Lorig-Roach, Ryan
Shafin, Kishwar
Lucas, Julian K
Aganezov, Sergey
Olson, Daniel
de Lima, Leonardo Gomes
Potapova, Tamara
Hartley, Gabrielle A
Haukness, Marina
Kerpedjiev, Peter
Gusev, Fedor
Tigyi, Kristof
Brooks, Shelise
Young, Alice
Nurk, Sergey
Koren, Sergey
Salama, Sofie R
Paten, Benedict
Rogaev, Evgeny I
Streets, Aaron
Karpen, Gary H
Dernburg, Abby F
Sullivan, Beth A
Straight, Aaron F
Wheeler, Travis J
Gerton, Jennifer L
Eichler, Evan E
Phillippy, Adam M
Timp, Winston
Dennis, Megan Y
O'Neill, Rachel J
Zook, Justin M
Schatz, Michael C
Pevzner, Pavel A
Diekhans, Mark
Langley, Charles H
Alexandrov, Ivan A
Miga, Karen H
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5
The complete sequence of a human genome
학술저널
issue
Science
. 376(6588)
Author
Nurk, Sergey
Koren, Sergey
Rhie, Arang
Rautiainen, Mikko
Bzikadze, Andrey V
Mikheenko
,
Alla
Vollger, Mitchell R
Altemose, Nicolas
Uralsky, Lev
Gershman, Ariel
Aganezov, Sergey
Hoyt, Savannah J
Diekhans, Mark
Logsdon, Glennis A
Alonge, Michael
Antonarakis, Stylianos E
Borchers, Matthew
Bouffard, Gerard G
Brooks, Shelise Y
Caldas, Gina V
Chen, Nae-Chyun
Cheng, Haoyu
Chin, Chen-Shan
Chow, William
de Lima, Leonardo G
Dishuck, Philip C
Durbin, Richard
Dvorkina, Tatiana
Fiddes, Ian T
Formenti, Giulio
Fulton, Robert S
Fungtammasan, Arkarachai
Garrison, Erik
Grady, Patrick GS
Graves-Lindsay, Tina A
Hall, Ira M
Hansen, Nancy F
Hartley, Gabrielle A
Haukness, Marina
Howe, Kerstin
Hunkapiller, Michael W
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Jain, Miten
Jarvis, Erich D
Kerpedjiev, Peter
Kirsche, Melanie
Kolmogorov, Mikhail
Korlach, Jonas
Kremitzki, Milinn
Li, Heng
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Marschall, Tobias
McCartney, Ann M
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Mullikin, James C
Myers, Eugene W
Olson, Nathan D
Paten, Benedict
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Pevzner, Pavel A
Porubsky, David
Potapova, Tamara
Rogaev, Evgeny I
Rosenfeld, Jeffrey A
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Schneider, Valerie A
Sedlazeck, Fritz J
Shafin, Kishwar
Shew, Colin J
Shumate, Alaina
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Walenz, Brian P
Wenger, Aaron
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Xiao, Chunlin
Yan, Stephanie M
Young, Alice C
Zarate, Samantha
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Dennis, Megan Y
Alexandrov, Ivan A
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O’Neill, Rachel J
Timp, Winston
Zook, Justin M
Schatz, Michael C
Eichler, Evan E
Miga, Karen H
Phillippy, Adam M
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Open Access (eScholarship)
6
MetaMiner: A Scalable Peptidogenomics Approach for Discovery of Ribosomal Peptide Natural Products with Blind Modifications from Microbial Communities
학술저널
issue
Cell Systems
. 9(6)
Author
Cao, Liu
Gurevich, Alexey
Alexander, Kelsey L
Naman, C Benjamin
Leão, Tiago
Glukhov, Evgenia
Luzzatto-Knaan, Tal
Vargas, Fernando
Quinn, Robby
Bouslimani, Amina
Nothias, Louis Felix
Singh, Nitin K
Sanders, Jon G
Benitez, Rodolfo AS
Thompson, Luke R
Hamid, Md-Nafiz
Morton, James T
Mikheenko
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Korobeynikov, Anton
Friedberg, Iddo
Knight, Rob
Venkateswaran, Kasthuri
Gerwick, William H
Gerwick, Lena
Dorrestein, Pieter C
Pevzner, Pavel A
Mohimani, Hosein
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Open Access (eScholarship)
7
Single-nuclei isoform RNA sequencing unlocks barcoded exon connectivity in frozen brain tissue
학술저널
issue
Nature Biotechnology: The Science and Business of Biotechnology
. 40(7):1082-1092
Author
Hardwick, Simon A.
Aff1, Aff2
Hu, Wen
Aff1, Aff2
Joglekar, Anoushka
Aff1, Aff2
Fan, Li
Aff1, Aff3
Collier, Paul G.
Aff1, Aff2
Foord, Careen
Aff1, Aff2
Balacco, Jennifer
Lanjewar, Samantha
Sampson, Maureen McGuirk
Koopmans, Frank
Prjibelski, Andrey D.
Mikheenko
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Alla
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Aff1, Aff2, Aff8
Jarroux, Julien
Aff1, Aff2
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Luo, Wenjie
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Aff1, Aff11
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Trojanowski, John Q.
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Fedrigo, Olivier
Sloan, Steven A.
Tombácz, Dóra
Ross, M. Elizabeth
Aff1, Aff2
Jarvis, Erich
Boldogkői, Zsolt
Gan, Li
Aff1, Aff3
Tilgner, Hagen U.
Aff1, Aff2, IDs41587022012313_cor30
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Chasing perfection: validation and polishing strategies for telomere-to-telomere genome assemblies
학술저널
issue
Nature Methods: Techniques for life scientists and chemists
. 19(6):687-695
Author
Mc Cartney, Ann M.
Shafin, Kishwar
Alonge, Michael
Bzikadze, Andrey V.
Formenti, Giulio
Fungtammasan, Arkarachai
Howe, Kerstin
Jain, Chirag
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Logsdon, Glennis A.
Miga, Karen H.
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Mikheenko
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Shumate, Alaina
Soto, Daniela C.
Sović, Ivan
Aff14, Aff15
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Zook, Justin M.
Phillippy, Adam M.
Aff1, IDs41592022014403_cor19
Rhie, Arang
Aff1, IDs41592022014403_cor20
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Database : Springer Nature Journals
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PolyGR and polyPR knock-in mice reveal a conserved neuroprotective extracellular matrix signature in C9orf72 ALS/FTD neurons
학술저널
issue
NATURE NEUROSCIENCE
; FEB 29 2024, 35p.
Author
Milioto, Carmelo
Carcole, Mireia
Giblin, Ashling
Coneys, Rachel
Attrebi, Olivia
Ahmed, Mhoriam
Harris, Samuel S.
Lee, Byung Il
Yang, Mengke
Ellingford, Robert A.
Nirujogi, Raja S.
Biggs, Daniel
Salomonsson, Sally
Zanovello, Matteo
de Oliveira, Paula
Katona, Eszter
Glaria, Idoia
Mikheenko
,
Alla
Geary, Bethany
Udine, Evan
Vaizoglu, Deniz
Anoar, Sharifah
Jotangiya, Khrisha
Crowley, Gerard
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A circuit synthesis technique based on network determinant expansion
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issue
2012 International Conference on Synthesis, Modeling, Analysis and Simulation Methods and Applications to Circuit Design (SMACD) Synthesis, Modeling, Analysis and Simulation Methods and Applications to Circuit Design (SMACD), 2012 International Conference on. :293-296 Sep, 2012
Author
Filaretov, Vladimir
Gorshkov, Konstantin
Mikheenko
,
Alla
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