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METLIN-CCS: an ion mobility spectrometry collision cross section database
학술저널
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Nature Methods: Techniques for life scientists and chemists
. 20(12):1836-1837
Author
Baker, Erin S.
Aff1, IDs41592023020785_cor1
Hoang, Corey
Uritboonthai, Winnie
Heyman, Heino M.
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Pratt, Brian
MacCoss, Michael
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Plumb, Robert
Aisporna, Aries
Siuzdak, Gary
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2
Utilizing Skyline to analyze lipidomics data containing liquid chromatography, ion mobility spectrometry and mass spectrometry dimensions
학술저널
issue
Nature Protocols: Recipes for Researchers
. 17(11):2415-2430
Author
Kirkwood, Kaylie I.
Pratt, Brian S.
Shulman, Nicholas
Tamura, Kaipo
MacCoss, Michael J.
MacLean
,
Brendan
X.
Baker, Erin S.
Aff1, Aff3, IDs41596022007146_cor7
DB Label
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Avant-garde: an automated data-driven DIA data curation tool
학술저널
issue
Nature Methods: Techniques for life scientists and chemists
. 17(12):1237-1244
Author
Vaca Jacome, Alvaro Sebastian
Aff1
Peckner, Ryan
Aff1, Aff4
Shulman, Nicholas
Krug, Karsten
DeRuff, Katherine C.
Officer, Adam
Christianson, Karen E.
MacLean
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Brendan
MacCoss, Michael J.
Carr, Steven A.
Jaffe, Jacob D.
Aff1, Aff3, Aff5
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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4
Localization and Quantification of Post-Translational Modifications of Proteins Using Electron Activated Dissociation Fragmentation on a Fast-Acquisition Time-of-Flight Mass Spectrometer
학술저널
issue
JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR MASS SPECTROMETRY
; SEP 11 2023, 34 10, p2199-p2210, 12p.
Author
Bons, Joanna
Hunter, Christie L.
Chupalov, Rita
Causon, Jason
Antonoplis, Alexandra
Rose, Jacob
MacLean
,
Brendan
Schilling, Birgit
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Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition
학술저널
issue
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
; SEP 8 2023, 11p.
Author
Heil, Lilian R.
Damoc, Eugen
Arrey, Tabiwang N.
Pashkova, Anna
Denisov, Eduard
Petzoldt, Johannes
Peterson, Amelia C.
Hsu, Chris
Searle, Brian C.
Shulman, Nicholas
Riffle, Michael
Connolly, Brian
Maclean
,
Brendan
X.
Remes, Philip M.
Senko, Michael W.
Stewart, Hamish I.
Hock, Christian
Makarov, Alexander A.
Hermanson, Daniel
Zabrouskov, Vlad
Wu, Christine C.
Maccoss, Michael J.
DB Label
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Targeted peptide measurements in biology and medicine: best practices for mass spectrometry-based assay development using a fit-for-purpose approach.
학술저널
issue
Molecular & cellular proteomics : MCP
. 13(3)
Author
Carr, Steven A
Abbatiello, Susan E
Ackermann, Bradley L
Borchers, Christoph
Domon, Bruno
Deutsch, Eric W
Grant, Russell P
Hoofnagle, Andrew N
Hüttenhain, Ruth
Koomen, John M
Liebler, Daniel C
Liu, Tao
MacLean
,
Brendan
Mani, DR
Mansfield, Elizabeth
Neubert, Hendrik
Paulovich, Amanda G
Reiter, Lukas
Vitek, Olga
Aebersold, Ruedi
Anderson, Leigh
Bethem, Robert
Blonder, Josip
Boja, Emily
Botelho, Julianne
Boyne, Michael
Bradshaw, Ralph A
Burlingame, Alma L
Chan, Daniel
Keshishian, Hasmik
Kuhn, Eric
Kinsinger, Christopher
Lee, Jerry SH
Lee, Sang-Won
Moritz, Robert
Oses-Prieto, Juan
Rifai, Nader
Ritchie, James
Rodriguez, Henry
Srinivas, Pothur R
Townsend, R Reid
Van Eyk, Jennifer
Whiteley, Gordon
Wiita, Arun
Weintraub, Susan
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
7
MSstats Version 4.0: Statistical Analyses of Quantitative Mass Spectrometry-Based Proteomic Experiments with Chromatography-Based Quantification at Scale
학술저널
issue
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
; APR 5 2023, 17p.
Author
Kohler, Devon
Staniak, Mateusz
Tsai, Tsung-Heng
Huang, Ting
Shulman, Nicholas
Bernhardt, Oliver M.
MacLean
,
Brendan
X.
Nesvizhskii, Alexey I.
Reiter, Lukas
Sabido, Eduard
Choi, Meena
Vitek, Olga
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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조회 - Impact Factor (JCR)
등재 - Web of Science
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8
Design, Implementation and Multisite Evaluation of a System Suitability Protocol for the Quantitative Assessment of Instrument Performance in Liquid Chromatography-Multiple Reaction Monitoring-MS (LC-MRM-MS)*
학술저널
issue
Molecular & Cellular Proteomics
. 12(9)
Author
Abbatiello, Susan E
Mani, DR
Schilling, Birgit
MacLean
,
Brendan
Zimmerman, Lisa J
Feng, Xingdong
Cusack, Michael P
Sedransk, Nell
Hall, Steven C
Addona, Terri
Allen, Simon
Dodder, Nathan G
Ghosh, Mousumi
Held, Jason M
Hedrick, Victoria
Inerowicz, H Dorota
Jackson, Angela
Keshishian, Hasmik
Kim, Jong Won
Lyssand, John S
Riley, C Paige
Rudnick, Paul
Sadowski, Pawel
Shaddox, Kent
Smith, Derek
Tomazela, Daniela
Wahlander, Asa
Waldemarson, Sofia
Whitwell, Corbin A
You, Jinsam
Zhang, Shucha
Kinsinger, Christopher R
Mesri, Mehdi
Rodriguez, Henry
Borchers, Christoph H
Buck, Charles
Fisher, Susan J
Gibson, Bradford W
Liebler, Daniel
MacCoss, Michael
Neubert, Thomas A
Paulovich, Amanda
Regnier, Fred
Skates, Steven J
Tempst, Paul
Wang, Mu
Carr, Steven A
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
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Improving Precursor Selectivity in Data-Independent Acquisition Using Overlapping Windows
학술저널
issue
Journal of The American Society for Mass Spectrometry: The official journal of The American Society for Mass Spectrometry
. 30(4):669-684
Author
Amodei, Dario
Aff1
Egertson, Jarrett
Aff2
MacLean
,
Brendan
X.
Aff2
Johnson, Richard
Aff2
Merrihew, Gennifer E.
Aff2
Keller, Austin
Aff2
Marsh, Don
Vitek, Olga
Aff3
Mallick, Parag
Aff1
MacCoss, Michael J.
Aff2
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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조회 - Impact Factor (JCR)
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10
Using Skyline to Analyze Data-Containing Liquid Chromatography, Ion Mobility Spectrometry, and Mass Spectrometry Dimensions
학술저널
issue
Journal of The American Society for Mass Spectrometry: The official journal of The American Society for Mass Spectrometry
. 29(11):2182-2188
Author
MacLean
,
Brendan
X.
Pratt, Brian S.
Egertson, Jarrett D.
MacCoss, Michael J.
Smith, Richard D.
Baker, Erin S.
Aff2
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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