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journal of physical chemistry b
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proceedings of the 10th congress of the portuguese society of biomechanics : cnb 2023
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journal of computational chemistry
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journal of physical chemistry b
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proceedings of the 10th congress of the portuguese society of biomechanics : cnb 2023
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advances in medical physics and healthcare engineering : proceedings of amphe 2020
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enhancing health and sports performance by design : proceedings of the 2019 movement, health & exercise (mohe) and international sports science conference (issc)
(
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(
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advancing sports and exercise via innovation : proceedings of the 9th asian south pacific association of sport psychology international congress (aspasp) 2022, kuching, malaysia
(
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(
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biopolymers
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gerontechnology iii : contributions to the third international workshop on gerontechnology, iwog 2020, october 5-6, 2020, evora, portugal
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proceedings of the national academy of sciences of the united states of america
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Multi-GPU UNRES for scalable coarse-grained simulations of very large protein systems
학술저널
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Computer Physics Communications
May 2024 298
Author
Ocetkiewicz, Krzysztof M.
Czaplewski, Cezary
Krawczyk, Henryk
Lipska, Agnieszka G.
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Proficz, Jerzy
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Czarnul, Paweł
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조회 - Impact Factor (JCR)
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Assessment of chemical‐crosslink‐assisted protein structure modeling in CASP13
학술저널
issue
Proteins Structure Function and Bioinformatics
. 87(12)
Author
Fajardo, J Eduardo
Shrestha, Rojan
Gil, Nelson
Belsom,
Adam
Crivelli, Silvia N
Czaplewski, Cezary
Fidelis, Krzysztof
Grudinin, Sergei
Karasikov, Mikhail
Karczyńska, Agnieszka S
Kryshtafovych, Andriy
Leitner, Alexander
Liwo
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Adam
Lubecka, Emilia A
Monastyrskyy, Bohdan
Pagès, Guillaume
Rappsilber, Juri
Sieradzan,
Adam
K
Sikorska, Celina
Trabjerg, Esben
Fiser, Andras
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Open Access (eScholarship)
3
Physics-Based Coarse-Grained Modeling in Bio- and Nanochemistry
전자책
issue
Practical Aspects of Computational Chemistry V
. :31-69
Author
Liwo
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Adam
Aff3, Aff4
Sieradzan,
Adam
K.
Aff5
Karczyńska, Agnieszka S.
Aff6, Aff7
Lubecka, Emilia A.
Aff8
Samsonov, Sergey A.
Aff5
Czaplewski, Cezary
Aff5
Krupa, Paweł
Aff9
Mozolewska, Magdalena
Aff10
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Long-Time Dynamics of Selected Molecular-Motor Components Using a Physics-Based Coarse-Grained Approach.
학술저널
issue
Biomolecules (2218-273X)
. Jun2023, Vol. 13 Issue 6, p941. 19p.
Author
Liwo
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Adam
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(AUTHOR)
adam
.
liwo
@ug.edu.pl
Pyrka, Maciej
1,2
(AUTHOR)
cezary.czaplewski@ug.edu.pl
Czaplewski, Cezary
1
(AUTHOR)
Peng, Xubiao
3
(AUTHOR)
xubiaopeng@bit.edu.cn
Niemi, Antti J.
4
(AUTHOR)
antti.niemi@su.se
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An analysis and evaluation of the WeFold collaborative for protein structure prediction and its pipelines in CASP11 and CASP12.
학술저널
issue
Scientific reports
. 8(1)
Author
Keasar, Chen
McGuffin, Liam J
Wallner, Björn
Chopra, Gaurav
Adhikari, Badri
Bhattacharya, Debswapna
Blake, Lauren
Bortot, Leandro Oliveira
Cao, Renzhi
Dhanasekaran, BK
Dimas, Itzhel
Faccioli, Rodrigo Antonio
Faraggi, Eshel
Ganzynkowicz, Robert
Ghosh, Sambit
Ghosh, Soma
Giełdoń, Artur
Golon, Lukasz
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Heo, Lim
Hou, Jie
Khan, Main
Khatib, Firas
Khoury, George A
Kieslich, Chris
Kim, David E
Krupa, Pawel
Lee, Gyu Rie
Li, Hongbo
Li, Jilong
Lipska, Agnieszka
Liwo
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Adam
Maghrabi, Ali Hassan A
Mirdita, Milot
Mirzaei, Shokoufeh
Mozolewska, Magdalena A
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Ovchinnikov, Sergey
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Sidi, Tomer
Sieradzan,
Adam
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Ślusarz, Magdalena
Ślusarz, Rafal
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Tamamis, Phanourios
Trieber, Nicholas
Wirecki, Tomasz
Yin, Yanping
Zhang, Yang
Bacardit, Jaume
Baranowski, Maciej
Chapman, Nicholas
Cooper, Seth
Defelicibus, Alexandre
Flatten, Jeff
Koepnick, Brian
Popović, Zoran
Zaborowski, Bartlomiej
Baker, David
Cheng, Jianlin
Czaplewski, Cezary
Delbem, Alexandre Cláudio Botazzo
Floudas, Christodoulos
Kloczkowski, Andrzej
Ołdziej, Stanislaw
Levitt, Michael
Scheraga, Harold
Seok, Chaok
Söding, Johannes
Vishveshwara, Saraswathi
Xu, Dong
Foldit Players consortium
Crivelli, Silvia N
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
6
Assessment of Two Restraint Potentials for Coarse-Grained Chemical-Cross-Link-Assisted Modeling of Protein Structures
학술저널
issue
JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING
; FEB 12 2024, 17p.
Author
Lesniewski, Mateusz
Pyrka, Maciej
Czaplewski, Cezary
Co, Nguyen Truong
Jiang, Yida
Gong, Zhou
Tang, Chun
Liwo
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Adam
DB Label
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7
Model of the external force field for the protein folding process -- the role of prefoldin.
학술저널
issue
Frontiers in Chemistry; 2024, p01-16, 16p
Author
Roterman, Irena
Stapor, Katarzyna
Konieczny, Leszek
Marcuello, Carlos
Liwo
,
Adam
DB Label
Database : Complementary Index
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조회 - Impact Factor (JCR)
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8
Extended disorder at the cell surface: The conformational landscape of the ectodomains of syndecans
학술저널
issue
In
Matrix Biology Plus
December 2021 12
Author
Gondelaud, Frank
Bouakil, Mathilde
Le Fèvre, Aurélien
Miele, Adriana Erica
Chirot, Fabien
Duclos, Bertrand
Liwo
,
Adam
Ricard-Blum, Sylvie
DB Label
Database : ScienceDirect
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Full Text (ScienceDirect O/A)
등재 - SCOPUS
9
Modeling protein structures with the coarse-grained UNRES force field in the CASP14 experiment
학술저널
issue
In
Journal of Molecular Graphics and Modelling
November 2021 108
Author
Antoniak, Anna
Biskupek, Iga
Bojarski, Krzysztof K.
Czaplewski, Cezary
Giełdoń, Artur
Kogut, Mateusz
Kogut, Małgorzata M.
Krupa, Paweł
Lipska, Agnieszka G.
Liwo
,
Adam
Lubecka, Emilia A.
Marcisz, Mateusz
Maszota-Zieleniak, Martyna
Samsonov, Sergey A.
Sieradzan,
Adam
K.
Ślusarz, Magdalena J.
Ślusarz, Rafał
Wesołowski, Patryk A.
Ziȩba, Karolina
DB Label
Database : ScienceDirect
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Full Text (ScienceDirect)
등재 - SCOPUS
조회 - Impact Factor (JCR)
등재 - Web of Science (SCIE)
10
Impact of AlphaFold on structure prediction of protein complexes: The CASP15-CAPRI experiment
학술저널
issue
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
; OCT 31 2023, 26p.
Author
Lensink, Marc F.
Brysbaert, Guillaume
Raouraoua, Nessim
Bates, Paul A.
Giulini, Marco
Honorato, Rodrigo V.
van Noort, Charlotte
Teixeira, Joao M. C.
Bonvin, Alexandre M. J. J.
Kong, Ren
Shi, Hang
Lu, Xufeng
Chang, Shan
Liu, Jian
Guo, Zhiye
Chen, Xiao
Morehead, Alex
Roy, Raj S.
Wu, Tianqi
Giri, Nabin
Quadir, Farhan
Chen, Chen
Cheng, Jianlin
Del Carpio, Carlos A.
Ichiishi, Eichiro
Rodriguez-Lumbreras, Luis A.
Fernandez-Recio, Juan
Harmalkar, Ameya
Chu, Lee-Shin
Canner, Sam
Smanta, Rituparna
Gray, Jeffrey J.
Li, Hao
Lin, Peicong
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