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A genomic timescale for placental mammal evolution
학술저널
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Science
. 380(6643)
Author
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Nicole
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Harris, Andrew J
Bredemeyer, Kevin R
Damas, Joana
Lewin, Harris A
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Karlsson, Elinor K
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Nicole
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Srinivasan, Chaitanya
Steiner, Cynthia
Storer, Jessica
M
Sullivan, Kevin AM
Sullivan, Patrick F
Sundström, Elisabeth
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
2
Comparative genomics of Balto, a famous historic dog, captures lost diversity of 1920s sled dogs
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Moon, Katherine L
Huson, Heather J
Morrill, Kathleen
Wang, Ming-Shan
Li, Xue
Srikanth, Krishnamoorthy
Lindblad-Toh, Kerstin
Svenson, Gavin J
Karlsson, Elinor K
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Supple, Megan A
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
3
The contribution of historical processes to contemporary extinction risk in placental mammals
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Wilder, Aryn P
Supple, Megan A
Subramanian, Ayshwarya
Mudide, Anish
Swofford, Ross
Serres-Armero, Aitor
Steiner, Cynthia
Koepfli, Klaus-Peter
Genereux, Diane P
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Lindblad-Toh, Kerstin
Marques-Bonet, Tomas
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Foley
, Kathleen
Meyer, Wynn K
Ryder, Oliver A
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Foley
,
Nicole
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Hiller, Michael
Hindle, Allyson G
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M
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Lind, Abigail
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Morrill, Kathleen
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
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The functional and evolutionary impacts of human-specific deletions in conserved elements
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Xue, James R
Mackay-Smith, Ava
Mouri, Kousuke
Garcia, Meilin Fernandez
Dong, Michael X
Akers, Jared F
Noble, Mark
Li, Xue
Lindblad-Toh, Kerstin
Karlsson, Elinor K
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Foley
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Nicole
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Schäffer, Daniel E
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Shapiro, Beth
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Springer, Mark
Srinivasan, Chaitanya
Steiner, Cynthia
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
5
Integrating gene annotation with orthology inference at scale
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Kirilenko, Bogdan
M
Munegowda, Chetan
Osipova, Ekaterina
Jebb, David
Sharma, Virag
Blumer, Moritz
Morales, Ariadna E
Ahmed, Alexis-Walid
Kontopoulos, Dimitrios-Georgios
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Dong, Michael X
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Foley
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Nicole
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M
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Koepfli, Klaus-Peter
Korstian, Jennifer
M
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Kozyrev, Sergey V
Lawler, Alyssa J
Lawless, Colleen
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Levesque, Danielle L
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Rosen, Jeb R
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Ryder, Oliver A
Sabeti, Pardis C
Schäffer, Daniel E
Serres, Aitor
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Smit, Arian FA
Springer, Mark
Srinivasan, Chaitanya
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M
Sullivan, Kevin AM
Sullivan, Patrick F
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
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Relating enhancer genetic variation across mammals to complex phenotypes using machine learning
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Kaplow, Irene
M
Lawler, Alyssa J
Schäffer, Daniel E
Srinivasan, Chaitanya
Sestili, Heather H
Wirthlin, Morgan E
Phan, BaDoi N
Prasad, Kavya
Brown, Ashley R
Zhang, Xiaomeng
Foley
, Kathleen
Genereux, Diane P
Karlsson, Elinor K
Lindblad-Toh, Kerstin
Meyer, Wynn K
Pfenning, Andreas R
Andrews, Gregory
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Birren, Bruce W
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Christmas, Matthew J
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Dong, Michael X
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M
Muntané, Gerard
Murphy, William J
Navarro, Arcadi
Nweeia, Martin
Ortmann, Sylvia
Osmanski, Austin
Paten, Benedict
Paulat,
Nicole
S
Pollard, Katherine S
Pratt, Henry E
Ray, David A
Reilly, Steven K
Rosen, Jeb R
Ruf, Irina
Ryan, Louise
Ryder, Oliver A
Sabeti, Pardis C
Serres, Aitor
Shapiro, Beth
Smit, Arian FA
Springer, Mark
Steiner, Cynthia
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
7
Three-dimensional genome rewiring in loci with human accelerated regions
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Keough, Kathleen C
Whalen, Sean
Inoue, Fumitaka
Przytycki, Pawel F
Fair, Tyler
Deng, Chengyu
Steyert, Marilyn
Ryu, Hane
Lindblad-Toh, Kerstin
Karlsson, Elinor
Nowakowski, Tomasz
Ahituv, Nadav
Pollen, Alex
Pollard, Katherine S
Andrews, Gregory
Armstrong, Joel C
Bianchi, Matteo
Birren, Bruce W
Bredemeyer, Kevin R
Breit, Ana
M
Christmas, Matthew J
Clawson, Hiram
Damas, Joana
Di Palma, Federica
Diekhans, Mark
Dong, Michael X
Eizirik, Eduardo
Fan, Kaili
Fanter, Cornelia
Foley
,
Nicole
M
Forsberg-Nilsson, Karin
Garcia, Carlos J
Gatesy, John
Gazal, Steven
Genereux, Diane P
Goodman, Linda
Grimshaw, Jenna
Halsey, Michaela K
Harris, Andrew J
Hickey, Glenn
Hiller, Michael
Hindle, Allyson G
Hubley, Robert
M
Hughes, Graham
M
Johnson, Jeremy
Juan, David
Kaplow, Irene
M
Karlsson, Elinor K
Kirilenko, Bogdan
Koepfli, Klaus-Peter
Korstian, Jennifer
M
Kowalczyk, Amanda
Kozyrev, Sergey V
Lawler, Alyssa J
Lawless, Colleen
Lehmann, Thomas
Levesque, Danielle L
Lewin, Harris A
Li, Xue
Lind, Abigail
Mackay-Smith, Ava
Marinescu, Voichita D
Marques-Bonet, Tomas
Mason, Victor C
Meadows, Jennifer RS
Meyer, Wynn K
Moore, Jill E
Moreira, Lucas R
Moreno-Santillan, Diana D
Morrill, Kathleen
M
Muntané, Gerard
Murphy, William J
Navarro, Arcadi
Nweeia, Martin
Ortmann, Sylvia
Osmanski, Austin
Paten, Benedict
Paulat,
Nicole
S
Pfenning, Andreas R
Phan, BaDoi N
Pratt, Henry E
Ray, David A
Reilly, Steven K
Rosen, Jeb R
Ruf, Irina
Ryan, Louise
Ryder, Oliver A
Sabeti, Pardis C
Schäffer, Daniel E
Serres, Aitor
Shapiro, Beth
Smit, Arian FA
Springer, Mark
Srinivasan, Chaitanya
Steiner, Cynthia
Storer, Jessica
M
Sullivan, Kevin AM
DB Label
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Open Access (eScholarship)
8
Evolutionary constraint and innovation across hundreds of placental mammals
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Christmas, Matthew J
Kaplow, Irene
M
Genereux, Diane P
Dong, Michael X
Hughes, Graham
M
Li, Xue
Sullivan, Patrick F
Hindle, Allyson G
Andrews, Gregory
Armstrong, Joel C
Bianchi, Matteo
Breit, Ana
M
Diekhans, Mark
Fanter, Cornelia
Foley
,
Nicole
M
Goodman, Daniel B
Goodman, Linda
Keough, Kathleen C
Kirilenko, Bogdan
Kowalczyk, Amanda
Lawless, Colleen
Lind, Abigail L
Meadows, Jennifer RS
Moreira, Lucas R
Redlich, Ruby W
Ryan, Louise
Swofford, Ross
Valenzuela, Alejandro
Wagner, Franziska
Wallerman, Ola
Brown, Ashley R
Damas, Joana
Fan, Kaili
Gatesy, John
Grimshaw, Jenna
Johnson, Jeremy
Kozyrev, Sergey V
Lawler, Alyssa J
Marinescu, Voichita D
Morrill, Kathleen
M
Osmanski, Austin
Paulat,
Nicole
S
Phan, BaDoi N
Reilly, Steven K
Schäffer, Daniel E
Steiner, Cynthia
Supple, Megan A
Wilder, Aryn P
Wirthlin, Morgan E
Xue, James R
Birren, Bruce W
Gazal, Steven
Hubley, Robert
M
Koepfli, Klaus-Peter
Marques-Bonet, Tomas
Meyer, Wynn K
Nweeia, Martin
Sabeti, Pardis C
Shapiro, Beth
Smit, Arian FA
Springer, Mark S
Teeling, Emma C
Weng, Zhiping
Hiller, Michael
Levesque, Danielle L
Lewin, Harris A
Murphy, William J
Navarro, Arcadi
Paten, Benedict
Pollard, Katherine S
Ray, David A
Ruf, Irina
Ryder, Oliver A
Pfenning, Andreas R
Lindblad-Toh, Kerstin
Karlsson, Elinor K
Bredemeyer, Kevin R
Clawson, Hiram
Di Palma, Federica
Eizirik, Eduardo
Forsberg-Nilsson, Karin
Garcia, Carlos J
Halsey, Michaela K
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
9
Leveraging base-pair mammalian constraint to understand genetic variation and human disease
학술저널
issue
Science
. 380(6643)
Author
Sullivan, Patrick F
Meadows, Jennifer RS
Gazal, Steven
Phan, BaDoi N
Li, Xue
Genereux, Diane P
Dong, Michael X
Bianchi, Matteo
Andrews, Gregory
Sakthikumar, Sharadha
Nordin, Jessika
Roy, Ananya
Christmas, Matthew J
Marinescu, Voichita D
Wang, Chao
Wallerman, Ola
Xue, James
Yao, Shuyang
Sun, Quan
Szatkiewicz, Jin
Wen, Jia
Huckins, Laura
M
Lawler, Alyssa
Keough, Kathleen C
Zheng, Zhili
Zeng, Jian
Wray, Naomi R
Li, Yun
Johnson, Jessica
Chen, Jiawen
Paten, Benedict
Reilly, Steven K
Hughes, Graham
M
Weng, Zhiping
Pollard, Katherine S
Pfenning, Andreas R
Forsberg-Nilsson, Karin
Karlsson, Elinor K
Lindblad-Toh, Kerstin
Armstrong, Joel C
Birren, Bruce W
Bredemeyer, Kevin R
Breit, Ana
M
Clawson, Hiram
Damas, Joana
Di Palma, Federica
Diekhans, Mark
Eizirik, Eduardo
Fan, Kaili
Fanter, Cornelia
Foley
,
Nicole
M
Garcia, Carlos J
Gatesy, John
Goodman, Linda
Grimshaw, Jenna
Halsey, Michaela K
Harris, Andrew J
Hickey, Glenn
Hiller, Michael
Hindle, Allyson G
Hubley, Robert
M
Johnson, Jeremy
Juan, David
Kaplow, Irene
M
Kirilenko, Bogdan
Koepfli, Klaus-Peter
Korstian, Jennifer
M
Kowalczyk, Amanda
Kozyrev, Sergey V
Lawler, Alyssa J
Lawless, Colleen
Lehmann, Thomas
Levesque, Danielle L
Lewin, Harris A
Lind, Abigail
Mackay-Smith, Ava
Marques-Bonet, Tomas
Mason, Victor C
Meyer, Wynn K
Moore, Jill E
Moreira, Lucas R
Moreno-Santillan, Diana D
Morrill, Kathleen
M
Muntané, Gerard
Murphy, William J
Navarro, Arcadi
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Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
10
Single-haplotype comparative genomics provides insights into lineage-specific structural variation during cat evolution
학술저널
issue
Nature Genetics
. 55(11):1953-1963
Author
Bredemeyer, Kevin R.
Aff1, Aff2
Hillier, LaDeana
Harris, Andrew J.
Aff1, Aff2
Hughes, Graham
M
.
Foley
,
Nicole
M
.
Lawless, Colleen
Carroll, Rachel A.
Storer, Jessica
M
.
Batzer, Mark A.
Rice, Edward S.
Davis, Brian W.
Aff1, Aff2
Raudsepp, Terje
Aff1, Aff2
O’Brien, Stephen J.
Lyons, Leslie A.
Warren, Wesley C.
Aff5, IDs4158802301548y_cor15
Murphy, William J.
Aff1, Aff2, IDs4158802301548y_cor16
DB Label
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