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proteins structure function and bioinformatics
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structure london england 1993
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ClusPro in rounds 38 to 45 of CAPRI: Toward combining template‐based methods with free docking
학술저널
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Proteins Structure Function and Bioinformatics
. 88(8)
Author
Padhorny, Dzmitry
Porter, Kathryn A
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Alekseenko, Andrey
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Alam, Nawsad
Sun, Zhuyezi
Brini, Emiliano
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Schueler‐Furman, Ora
Vajda, Sandor
Kozakov, Dima
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Open Access (eScholarship)
2
The ClusPro AbEMap web server for the prediction of antibody epitopes
학술저널
issue
NATURE PROTOCOLS
; MAY 15 2023, 34p.
Author
Desta
,
Israel
T.
Kotelnikov, Sergei
Jones, George
Ghani, Usman
Abyzov, Mikhail
Kholodov, Yaroslav
Standley, Daron M.
Beglov, Dmitri
Vajda, Sandor
Kozakov, Dima
DB Label
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3
Detecting and Trapping of a Single C. elegans Worm in a Microfluidic Chip for Automated Microplate Dispensing
학술저널
issue
In
SLAS Technology
August 2017 22(4):431-436
Author
Desta
,
Israel
T.
**
Al-Sharif, Abdelrazak
**
AlGharibeh, Nour
Mustafa, Nahal
Orozaliev, Ajymurat
Giakoumidis, Nikolaos
Gunsalus, Kristin C.
Song, Yong-Ak
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Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
학술저널
issue
PROTEIN SCIENCE
; FEB 2023, 32 2, pe4554 18p.
Author
Li, Alex J.
Lu, Mindren
Desta
,
Israel
Sundar, Vikram
Grigoryan, Gevorg
Keating, Amy E.
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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Mapping of antibody epitopes based on docking and homology modeling
학술저널
issue
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
; SEP 30 2022, 12p.
Author
Desta
,
Israel
T.
Kotelnikov, Sergei
Jones, George
Ghani, Usman
Abyzov, Mikhail
Kholodov, Yaroslav
Standley, Daron M.
Sabitova, Maria
Beglov, Dmitri
Vajda, Sandor
Kozakov, Dima
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6
Mapping of antibody epitopes based on docking and homology modeling.
학술저널
issue
Proteins; Feb2023, Vol. 91 Issue 2, p171-182, 12p
Author
Desta
,
Israel
T.
Kotelnikov, Sergei
Jones, George
Ghani, Usman
Abyzov, Mikhail
Kholodov, Yaroslav
Standley, Daron M.
Sabitova, Maria
Beglov, Dmitri
Vajda, Sandor
Kozakov, Dima
DB Label
Database : Complementary Index
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Mechanically Responsive Crystals: Analysis of Macroscopic Strain Reveals "Hidden" Processes.
학술저널
issue
Journal of Physical Chemistry A; 12/1/2022, Vol. 126 Issue 47, p300-310, 11p
Author
Desta
,
Israel
Tilahun
Chizhik, Stanislav A.
Sidelnikov, Anatoli A.
Karothu, Durga Prasad
Boldyreva, Elena V.
Naumov, Panče
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Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment
학술저널
issue
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
; SEP 13 2021, 24p.
Author
Lensink, Marc F.
Brysbaert, Guillaume
Mauri, Theo
Nadzirin, Nurul
Velankar, Sameer
Chaleil, Raphael A. G.
Clarence, Tereza
Bates, Paul A.
Kong, Ren
Liu, Bin
Yang, Guangbo
Liu, Ming
Shi, Hang
Lu, Xufeng
Chang, Shan
Roy, Raj S.
Quadir, Farhan
Liu, Jian
Cheng, Jianlin
Antoniak, Anna
Czaplewski, Cezary
Gieldon, Artur
Kogut, Mateusz
Lipska, Agnieszka G.
Liwo, Adam
Lubecka, Emilia A.
Maszota-Zieleniak, Martyna
Sieradzan, Adam K.
Slusarz, Rafal
Wesolowski, Patryk A.
Zieba, Karolina
Del Carpio Munoz, Carlos A.
Ichiishi, Eiichiro
Harmalkar, Ameya
Gray, Jeffrey J.
Bonvin, Alexandre M. J. J.
Ambrosetti, Francesco
Vargas Honorato, Rodrigo
Jandova, Zuzana
Jimenez-Garcia, Brian
Koukos, Panagiotis I.
Van Keulen, Siri
Van Noort, Charlotte W.
Reau, Manon
Roel-Touris, Jorge
Kotelnikov, Sergei
Padhorny, Dzmitry
Porter, Kathryn A.
Alekseenko, Andrey
Ignatov, Mikhail
Desta
,
Israel
Ashizawa, Ryota
Sun, Zhuyezi
Ghani, Usman
Hashemi, Nasser
Vajda, Sandor
Kozakov, Dima
Rosell, Mireia
Rodriguez-Lumbreras, Luis A.
Fernandez-Recio, Juan
Karczynska, Agnieszka
Grudinin, Sergei
Yan, Yumeng
Li, Hao
Lin, Peicong
Huang, Sheng-You
Christoffer, Charles
Terashi, Genki
Verburgt, Jacob
Sarkar, Daipayan
Aderinwale, Tunde
Wang, Xiao
Kihara, Daisuke
Nakamura, Tsukasa
Hanazono, Yuya
Gowthaman, Ragul
Guest, Johnathan D.
Yin, Rui
Taherzadeh, Ghazaleh
Pierce, Brian G.
Barradas-Bautista, Didier
Cao, Zhen
Cavallo, Luigi
Oliva, Romina
Sun, Yuanfei
Zhu, Shaowen
Shen, Yang
Park, Taeyong
Woo, Hyeonuk
Yang, Jinsol
Kwon, Sohee
Won, Jonghun
Seok, Chaok
Kiyota, Yasuomi
Kobayashi, Shinpei
Harada, Yoshiki
Takeda-Shitaka, Mayuko
Kundrotas, Petras J.
Singh, Amar
Vakser, Ilya A.
Dapkunas, Justas
Olechnovic, Kliment
Venclovas, Ceslovas
Duan, Rui
Qiu, Liming
Xu, Xianjin
Zhang, Shuang
Zou, Xiaoqin
Wodak, Shoshana J.
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Assessing the binding properties of CASP14 targets and models
학술저널
issue
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
; AUG 19 2021, 18p.
Author
Egbert, Megan
Ghani, Usman
Ashizawa, Ryota
Kotelnikov, Sergei
Nguyen, Thu
Desta
,
Israel
Hashemi, Nasser
Padhorny, Dzmitry
Kozakov, Dima
Vajda, Sandor
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Improved cluster ranking in protein-protein docking using a regression approach
학술저널
issue
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL
; 2021, 19 p2269-p2278, 10p.
Author
Sotudian, Shahabeddin
Desta
,
Israel
T.
Hashemi, Nasser
Zarbafian, Shahrooz
Kozakov, Dima
Vakili, Pirooz
Vajda, Sandor
Paschalidis, Ioannis Ch
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한국해양연구원(KORDI)
한국화학연구원(KRICT)
한국환경정책평가연구원
화학공학연구정보센터(고려대학교)
환경지질연구정보센터(연세대학교)
