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(19)
주제
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genomics
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biological sciences
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algorithms
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bioinformatics and computational biology
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nucleotide sequencing
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alignment
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chromosome mapping
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chromosomes
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evolution
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간행물
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plos genetics
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bioinformatics oxford england
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emerging topics in life sciences
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science new york n y
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bmc bioinformatics vol 13, iss 1 1471-2105
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research in computational molecular biology : 15th annual international conference, recomb 2011, vancouver, bc, canada, march 28-31, 2011. proceedings
(
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research in computational molecular biology : 21st annual international conference, recomb 2017, hong kong, china, may 3-7, 2017, proceedings
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research in computational molecular biology annual international conference recomb proceedings recomb conference 2005
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research square
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Scalable, accessible and reproducible reference genome assembly and evaluation in Galaxy
학술저널
issue
Nature Biotechnology: The Science and Business of Biotechnology
. 42(3):367-370
Author
Larivière, Delphine
Abueg, Linelle
Brajuka, Nadolina
Gallardo-Alba, Cristóbal
Grüning, Bjorn
Ko, Byung June
Ostrovsky, Alex
Palmada-Flores, Marc
Pickett, Brandon D.
Rabbani, Keon
Antunes, Agostinho
Aff9, Aff10
Balacco, Jennifer R.
Chaisson
,
Mark
J. P.
Cheng, Haoyu
Aff11, Aff12
Collins, Joanna
Couture, Melanie
Denisova, Alexandra
Fedrigo, Olivier
Gallo, Guido Roberto
Giani, Alice Maria
Gooder, Grenville MacDonald
Horan, Kathleen
Jain, Nivesh
Johnson, Cassidy
Kim, Heebal
Aff4, Aff17, Aff18
Lee, Chul
Aff18, Aff19
Marques-Bonet, Tomas
Aff6, Aff20, Aff21, Aff22
O’Toole, Brian
Rhie, Arang
Secomandi, Simona
Sozzoni, Marcella
Tilley, Tatiana
Uliano-Silva, Marcela
van den Beek, Marius
Williams, Robert W.
Waterhouse, Robert M.
Phillippy, Adam M.
Jarvis, Erich D.
Aff2, IDs41587023021003_cor38
Schatz, Michael C.
Aff5, IDs41587023021003_cor39
Nekrutenko, Anton
Aff1, IDs41587023021003_cor40
Formenti, Giulio
Aff2, IDs41587023021003_cor41
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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조회 - Impact Factor (JCR)
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2
Gaps and complex structurally variant loci in phased genome assemblies
학술저널
issue
Genome Research
. 33(4)
Author
Porubsky, David
Vollger, Mitchell R
Harvey, William T
Rozanski, Allison N
Ebert, Peter
Hickey, Glenn
Hasenfeld, Patrick
Sanders, Ashley D
Stober, Catherine
Consortium, Human Pangenome Reference
Korbel, Jan O
Paten, Benedict
Marschall, Tobias
Eichler, Evan E
Abel, Haley J
Antonacci-Fulton, Lucinda L
Asri, Mobin
Baid, Gunjan
Baker, Carl A
Belyaeva, Anastasiya
Billis, Konstantinos
Bourque, Guillaume
Buonaiuto, Silvia
Carroll, Andrew
Chaisson
,
Mark
JP
Chang, Pi-Chuan
Chang, Xian H
Cheng, Haoyu
Chu, Justin
Cody, Sarah
Colonna, Vincenza
Cook, Daniel E
Cook-Deegan, Robert M
Cornejo, Omar E
Diekhans,
Mark
Doerr, Daniel
Ebler, Jana
Eizenga, Jordan M
Fairley, Susan
Fedrigo, Olivier
Felsenfeld, Adam L
Feng, Xiaowen
Fischer, Christian
Flicek, Paul
Formenti, Giulio
Frankish, Adam
Fulton, Robert S
Gao, Yan
Garg, Shilpa
Garrison, Erik
Garrison, Nanibaa’ A
Giron, Carlos Garcia
Green, Richard E
Groza, Cristian
Guarracino, Andrea
Haggerty, Leanne
Hall, Ira M
Haukness, Marina
Haussler, David
Heumos, Simon
Hoekzema, Kendra
Hourlier, Thibaut
Howe, Kerstin
Jain, Miten
Jarvis, Erich D
Ji, Hanlee P
Kenny, Eimear E
Koenig, Barbara A
Kolesnikov, Alexey
Kordosky, Jennifer
Koren, Sergey
Lee, HoJoon
Lewis, Alexandra P
Li, Heng
Liao, Wen-Wei
Lu, Shuangjia
Lu, Tsung-Yu
Lucas, Julian K
Magalhães, Hugo
Marco-Sola, Santiago
Marijon, Pierre
Markello, Charles
Martin, Fergal J
McCartney, Ann
McDaniel, Jennifer
Miga, Karen H
Mitchell, Matthew W
Monlong, Jean
Mountcastle, Jacquelyn
Munson, Katherine M
Mwaniki, Moses Njagi
Nattestad, Maria
Novak, Adam M
Nurk, Sergey
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
3
HQAlign: Aligning nanopore reads for SV detection using current-level modeling
보고서
Author
Joshi, Dhaivat
Diggavi, Suhas
Chaisson
,
Mark
J. P.
Kannan, Sreeram
DB Label
Database : arXiv
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Open Access (Arxiv)
4
Scalable Nanopore sequencing of human genomes provides a comprehensive view of haplotype-resolved variation and methylation
학술저널
issue
Nature Methods: Techniques for life scientists and chemists
. 20(10):1483-1492
Author
Kolmogorov, Mikhail
Aff1, IDs4159202301993x_cor1
Billingsley, Kimberley J.
Aff2, Aff3, IDs4159202301993x_cor2
Mastoras, Mira
Meredith, Melissa
Monlong, Jean
Lorig-Roach, Ryan
Asri, Mobin
Alvarez Jerez, Pilar
Malik, Laksh
Dewan, Ramita
Reed, Xylena
Genner, Rylee M.
Daida, Kensuke
Aff2, Aff3
Behera, Sairam
Shafin, Kishwar
Pesout, Trevor
Prabakaran, Jeshuwin
Aff1, Aff7
Carnevali, Paolo
Yang, Jianzhi
Rhie, Arang
Scholz, Sonja W.
Aff11, Aff12
Traynor, Bryan J.
Aff3, Aff12
Miga, Karen H.
Jain, Miten
Aff13, Aff14
Timp, Winston
Phillippy, Adam M.
Chaisson
,
Mark
Sedlazeck, Fritz J.
Aff5, Aff16
Blauwendraat, Cornelis
Aff2, Aff3, IDs4159202301993x_cor29
Paten, Benedict
Aff4, IDs4159202301993x_cor30
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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조회 - Impact Factor (JCR)
등재 - Web of Science (SCIE)
등재 - SCOPUS
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5
Semi-automated assembly of high-quality diploid human reference genomes
학술저널
issue
Nature
. 611(7936)
Author
Jarvis, Erich D
Formenti, Giulio
Rhie, Arang
Guarracino, Andrea
Yang, Chentao
Wood, Jonathan
Tracey, Alan
Thibaud-Nissen, Francoise
Vollger, Mitchell R
Porubsky, David
Cheng, Haoyu
Asri, Mobin
Logsdon, Glennis A
Carnevali, Paolo
Chaisson
,
Mark
JP
Chin, Chen-Shan
Cody, Sarah
Collins, Joanna
Ebert, Peter
Escalona, Merly
Fedrigo, Olivier
Fulton, Robert S
Fulton, Lucinda L
Garg, Shilpa
Gerton, Jennifer L
Ghurye, Jay
Granat, Anastasiya
Green, Richard E
Harvey, William
Hasenfeld, Patrick
Hastie, Alex
Haukness, Marina
Jaeger, Erich B
Jain, Miten
Kirsche, Melanie
Kolmogorov, Mikhail
Korbel, Jan O
Koren, Sergey
Korlach, Jonas
Lee, Joyce
Li, Daofeng
Lindsay, Tina
Lucas, Julian
Luo, Feng
Marschall, Tobias
Mitchell, Matthew W
McDaniel, Jennifer
Nie, Fan
Olsen, Hugh E
Olson, Nathan D
Pesout, Trevor
Potapova, Tamara
Puiu, Daniela
Regier, Allison
Ruan, Jue
Salzberg, Steven L
Sanders, Ashley D
Schatz, Michael C
Schmitt, Anthony
Schneider, Valerie A
Selvaraj, Siddarth
Shafin, Kishwar
Shumate, Alaina
Stitziel, Nathan O
Stober, Catherine
Torrance, James
Wagner, Justin
Wang, Jianxin
Wenger, Aaron
Xiao, Chuanle
Zimin, Aleksey V
Zhang, Guojie
Wang, Ting
Li, Heng
Garrison, Erik
Haussler, David
Hall, Ira
Zook, Justin M
Eichler, Evan E
Phillippy, Adam M
Paten, Benedict
Howe, Kerstin
Miga, Karen H
DB Label
Database : eScholarship
원문보기
Open Access (eScholarship)
6
A haplotype-resolved genome assembly of the Nile rat facilitates exploration of the genetic basis of diabetes.
학술저널
issue
Journal of Biology
. 20(1)
Author
Toh, Huishi
Yang, Chentao
Formenti, Giulio
Raja, Kalpana
Yan, Lily
Tracey, Alan
Chow, William
Howe, Kerstin
Bergeron, Lucie
Zhang, Guojie
Haase, Bettina
Mountcastle, Jacquelyn
Fedrigo, Olivier
Fogg, John
Kirilenko, Bogdan
Munegowda, Chetan
Hiller, Michael
Jain, Aashish
Kihara, Daisuke
Rhie, Arang
Phillippy, Adam
Swanson, Scott
Jiang, Peng
Jarvis, Erich
Thomson, James
Stewart, Ron
Chaisson
,
Mark
Bukhman, Yury
Clegg, Dennis
DB Label
Database : eScholarship
원문보기
Open Access (eScholarship)
7
vamos: variable-number tandem repeats annotation using efficient motif sets
학술저널
issue
Genome Biology
. 24(1)
Author
Ren, Jingwen
Gu, Bida
Chaisson
,
Mark
J. P.
Aff1, IDs1305902303010y_cor3
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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OA (Springer)
Open Access (BioMed Central)
조회 - Impact Factor (JCR)
등재 - Web of Science (SCIE)
등재 - SCOPUS
8
The Human Pangenome Project: a global resource to map genomic diversity
학술저널
issue
Nature
. 604(7906)
Author
Wang, Ting
Antonacci-Fulton, Lucinda
Howe, Kerstin
Lawson, Heather A
Lucas, Julian K
Phillippy, Adam M
Popejoy, Alice B
Asri, Mobin
Carson, Caryn
Chaisson
,
Mark
JP
Chang, Xian
Cook-Deegan, Robert
Felsenfeld, Adam L
Fulton, Robert S
Garrison, Erik P
Garrison, Nanibaa’ A
Graves-Lindsay, Tina A
Ji, Hanlee
Kenny, Eimear E
Koenig, Barbara A
Li, Daofeng
Marschall, Tobias
McMichael, Joshua F
Novak, Adam M
Purushotham, Deepak
Schneider, Valerie A
Schultz, Baergen I
Smith, Michael W
Sofia, Heidi J
Weissman, Tsachy
Flicek, Paul
Li, Heng
Miga, Karen H
Paten, Benedict
Jarvis, Erich D
Hall, Ira M
Eichler, Evan E
Haussler, David
DB Label
Database : eScholarship
원문보기
Open Access (eScholarship)
9
A draft human pangenome reference
학술저널
issue
Nature: International weekly journal of science
. 617(7960):312-324
Author
Liao, Wen-Wei
Aff1, Aff2, Aff3
Asri, Mobin
Ebler, Jana
Aff5, Aff6
Doerr, Daniel
Aff5, Aff6
Haukness, Marina
Hickey, Glenn
Lu, Shuangjia
Aff1, Aff2
Lucas, Julian K.
Monlong, Jean
Abel, Haley J.
Buonaiuto, Silvia
Chang, Xian H.
Cheng, Haoyu
Aff9, Aff10
Chu, Justin
Colonna, Vincenza
Aff8, Aff11
Eizenga, Jordan M.
Feng, Xiaowen
Aff9, Aff10
Fischer, Christian
Fulton, Robert S.
Aff12, Aff13
Garg, Shilpa
Groza, Cristian
Guarracino, Andrea
Aff11, Aff16
Harvey, William T.
Heumos, Simon
Aff18, Aff19
Howe, Kerstin
Jain, Miten
Lu, Tsung-Yu
Markello, Charles
Martin, Fergal J.
Mitchell, Matthew W.
Munson, Katherine M.
Mwaniki, Moses Njagi
Novak, Adam M.
Olsen, Hugh E.
Pesout, Trevor
Porubsky, David
Prins, Pjotr
Sibbesen, Jonas A.
Sirén, Jouni
Tomlinson, Chad
Villani, Flavia
Vollger, Mitchell R.
Aff17, Aff27
Antonacci-Fulton, Lucinda L.
Baid, Gunjan
Baker, Carl A.
Belyaeva, Anastasiya
Billis, Konstantinos
Carroll, Andrew
Chang, Pi-Chuan
Cody, Sarah
Cook, Daniel E.
Cook-Deegan, Robert M.
Cornejo, Omar E.
Diekhans,
Mark
Ebert, Peter
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Fairley, Susan
Fedrigo, Olivier
Felsenfeld, Adam L.
Formenti, Giulio
Frankish, Adam
Gao, Yan
Garrison, Nanibaa’ A.
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Giron, Carlos Garcia
Green, Richard E.
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Haggerty, Leanne
Hoekzema, Kendra
Hourlier, Thibaut
Ji, Hanlee P.
Kenny, Eimear E.
Koenig, Barbara A.
Kolesnikov, Alexey
Korbel, Jan O.
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Kordosky, Jennifer
Koren, Sergey
Lee, HoJoon
Lewis, Alexandra P.
Magalhães, Hugo
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Marco-Sola, Santiago
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Marijon, Pierre
Aff5, Aff6
McCartney, Ann
McDaniel, Jennifer
Mountcastle, Jacquelyn
Nattestad, Maria
Nurk, Sergey
Olson, Nathan D.
Popejoy, Alice B.
Puiu, Daniela
Rautiainen, Mikko
Regier, Allison A.
Rhie, Arang
Sacco, Samuel
Sanders, Ashley D.
Schneider, Valerie A.
Schultz, Baergen I.
Shafin, Kishwar
Smith, Michael W.
Sofia, Heidi J.
Abou Tayoun, Ahmad N.
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Thibaud-Nissen, Françoise
Tricomi, Francesca Floriana
Wagner, Justin
Walenz, Brian
Wood, Jonathan M. D.
Zimin, Aleksey V.
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Bourque, Guillaume
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Chaisson
,
Mark
J. P.
Flicek, Paul
Phillippy, Adam M.
Zook, Justin M.
Eichler, Evan E.
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Haussler, David
Aff4, Aff58
Wang, Ting
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Jarvis, Erich D.
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Miga, Karen H.
Garrison, Erik
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Marschall, Tobias
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Hall, Ira M.
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Li, Heng
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Paten, Benedict
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Database : Springer Nature Journals
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10
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species
학술저널
issue
Nature
. 592(7856)
Author
Rhie, Arang
McCarthy, Shane A
Fedrigo, Olivier
Damas, Joana
Formenti, Giulio
Koren, Sergey
Uliano-Silva, Marcela
Chow, William
Fungtammasan, Arkarachai
Kim, Juwan
Lee, Chul
Ko, Byung June
Chaisson
,
Mark
Gedman, Gregory L
Cantin, Lindsey J
Thibaud-Nissen, Francoise
Haggerty, Leanne
Bista, Iliana
Smith, Michelle
Haase, Bettina
Mountcastle, Jacquelyn
Winkler, Sylke
Paez, Sadye
Howard, Jason
Vernes, Sonja C
Lama, Tanya M
Grutzner, Frank
Warren, Wesley C
Balakrishnan, Christopher N
Burt, Dave
George, Julia M
Biegler, Matthew T
Iorns, David
Digby, Andrew
Eason, Daryl
Robertson, Bruce
Edwards, Taylor
Wilkinson,
Mark
Turner, George
Meyer, Axel
Kautt, Andreas F
Franchini, Paolo
Detrich, H William
Svardal, Hannes
Wagner, Maximilian
Naylor, Gavin JP
Pippel, Martin
Malinsky, Milan
Mooney,
Mark
Simbirsky, Maria
Hannigan, Brett T
Pesout, Trevor
Houck, Marlys
Misuraca, Ann
Kingan, Sarah B
Hall, Richard
Kronenberg, Zev
Sović, Ivan
Dunn, Christopher
Ning, Zemin
Hastie, Alex
Lee, Joyce
Selvaraj, Siddarth
Green, Richard E
Putnam, Nicholas H
Gut, Ivo
Ghurye, Jay
Garrison, Erik
Sims, Ying
Collins, Joanna
Pelan, Sarah
Torrance, James
Tracey, Alan
Wood, Jonathan
Dagnew, Robel E
Guan, Dengfeng
London, Sarah E
Clayton, David F
Mello, Claudio V
Friedrich, Samantha R
Lovell, Peter V
Osipova, Ekaterina
Al-Ajli, Farooq O
Secomandi, Simona
Kim, Heebal
Theofanopoulou, Constantina
Hiller, Michael
Zhou, Yang
Harris, Robert S
Makova, Kateryna D
Medvedev, Paul
Hoffman, Jinna
Masterson, Patrick
Clark, Karen
Martin, Fergal
Howe, Kevin
Flicek, Paul
Walenz, Brian P
Kwak, Woori
Clawson, Hiram
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Database : eScholarship
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