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bioinformatics research and applications : 17th international symposium, isbra 2021, shenzhen, china, november 26-28, 2021, proceedings
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Genomic reproducibility in the bioinformatics era
보고서
Author
Baykal
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Pelin
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Łabaj, Paweł P.
Markowetz, Florian
Schriml, Lynn M.
Stekhoven, Daniel J.
Mangul, Serghei
Beerenwinkel, Niko
DB Label
Database : arXiv
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Open Access (Arxiv)
2
Unlocking capacities of genomics for the COVID-19 response and future pandemics
학술저널
issue
Nature Methods
. 19(4)
Author
Knyazev, Sergey
Chhugani, Karishma
Sarwal, Varuni
Ayyala, Ram
Singh, Harman
Karthikeyan, Smruthi
Deshpande, Dhrithi
Baykal
,
Pelin
Icer
Comarova, Zoia
Lu, Angela
Porozov, Yuri
Vasylyeva, Tetyana I
Wertheim, Joel O
Tierney, Braden T
Chiu, Charles Y
Sun, Ren
Wu, Aiping
Abedalthagafi, Malak S
Pak, Victoria M
Nagaraj, Shivashankar H
Smith, Adam L
Skums, Pavel
Pasaniuc, Bogdan
Komissarov, Andrey
Mason, Christopher E
Bortz, Eric
Lemey, Philippe
Kondrashov, Fyodor
Beerenwinkel, Niko
Lam, Tommy Tsan-Yuk
Wu, Nicholas C
Zelikovsky, Alex
Knight, Rob
Crandall, Keith A
Mangul, Serghei
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
3
Reproducibility of Bioinformatics Tools
회의자료
issue
2022 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW) IPDPSW Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW), 2022 IEEE International. :216-216 May, 2022
Author
Baykal
,
Pelin
Icer
Beerenwinkel, Niko
Mangul, Serghei
DB Label
Database : IEEE Xplore Digital Library
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Full Text (IEEE)
4
Technology dictates algorithms: Recent developments in read alignment
보고서
issue
Genome Biol . Aug 26;22(1):249, 2021
Author
Alser, Mohammed
Rotman, Jeremy
Taraszka, Kodi
Shi, Huwenbo
Baykal
,
Pelin
Icer
Yang, Harry Taegyun
Xue, Victor
Knyazev, Sergey
Singer, Benjamin D.
Balliu, Brunilda
Koslicki, David
Skums, Pavel
Zelikovsky, Alex
Alkan, Can
Mutlu, Onur
Mangul, Serghei
DB Label
Database : arXiv
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Open Access (Arxiv)
5
A Novel Network Representation of SARS-CoV-2 Sequencing Data
전자책
issue
Bioinformatics Research and Applications : 17th International Symposium, ISBRA 2021, Shenzhen, China, November 26–28, 2021, Proceedings
. 13064:165-175
Author
Knyazev, Sergey
Aff12
Novikov, Daniel
Aff13
Grinshpon, Mark
Aff14
Singh, Harman
Aff15
Ayyala, Ram
Aff16
Sarwal, Varuni
Aff17
Hosseini, Roya
Aff13
Baykal
,
Pelin
Icer
Aff18, Aff19
Skums, Pavel
Aff13
Campbell, Ellsworth
Aff13
Mangul, Serghei
Aff16
Zelikovsky, Alex
Aff13
DB Label
Database : Springer Nature eBooks
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6
Assessment of HCV infection stage as recent or chronic using multi-parameter analysis and machine learning
회의자료
issue
2017 IEEE 7th International Conference on Computational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS) Computational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS), 2017 IEEE 7th International Conference on. :1-1 Oct, 2017
Author
Baykal
,
Pelin
Icer
Artyomenko, Alexander
Ramachandran, Sumathi
Khudyakov, Yury
Zelikovsky, Alex
Skums, Pavel
DB Label
Database : IEEE Xplore Digital Library
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Technology dictates algorithms: recent developments in read alignment
학술저널
issue
Genome Biology
. 22(1)
Author
Alser, Mohammed
Aff1, Aff2, Aff3
Rotman, Jeremy
Deshpande, Dhrithi
Taraszka, Kodi
Shi, Huwenbo
Aff6, Aff7
Baykal
,
Pelin
Icer
Yang, Harry Taegyun
Aff4, Aff9
Xue, Victor
Knyazev, Sergey
Singer, Benjamin D.
Aff10, Aff11, Aff12
Balliu, Brunilda
Koslicki, David
Aff14, Aff15, Aff16
Skums, Pavel
Zelikovsky, Alex
Aff8, Aff17
Alkan, Can
Aff2, Aff18
Mutlu, Onur
Aff1, Aff2, Aff3
Mangul, Serghei
Aff5
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Analysis of heterogeneous genomic samples using image normalization and machine learning
학술저널
issue
BMC Genomics
. 21(Suppl 6)
Author
Basodi, Sunitha
Aff1
Baykal
,
Pelin
Icer
Zelikovsky, Alex
Aff1, Aff2
Skums, Pavel
Pan, Yi
DB Label
Database : Springer Nature Journals
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SOPHIE: Viral outbreak investigation and transmission history reconstruction in a joint phylogenetic and network theory framework
학술저널
issue
CELL SYSTEMS
; OCT 19 2022, 13 10, p844-p+, 18p.
Author
Skums, Pavel
Mohebbi, Fatemeh
Tsyvina, Vyacheslav
Baykal
,
Pelin
Icer
Nemira, Alina
Ramachandran, Sumathi
Khudyakov, Yury
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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10
Wastewater monitoring of SARS-CoV-2 shows high correlation with COVID-19 case numbers and allowed early detection of the first confirmed B.1.1.529 infection in Switzerland: results of an observational surveillance study
학술저널
issue
SWISS MEDICAL WEEKLY
; JUN 27 2022, 152 pw30202 7p.
Author
Bagutti, Claudia
Hug, Monica Alt
Heim, Philippe
Pekerman, Laura Maurer
Hampe, Evelyn Ilg
Hubner, Philipp
Fuchs, Simon
Savic, Miodrag
Stadler, Tanja
Topolsky, Ivan
Baykal
,
Pelin
Icer
Dreifuss, David
Beerenwinkel, Niko
Sutter, Sarah Tschudin
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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